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CNRGV

CNRGV
Responsable : Hélène BERGES
Adresse : Centre National de Ressources Genomiques Vegetales
INRA - CNRGV
Chemin de Borde Rouge
BP 52627
31326 Castanet Tolosan

complements

Certification ISO

Site web

http://cnrgv.toulouse.inra.fr/

Presentation du CRB

- Collecter, valider et entretenir les collections génomiques des plantes modèles et cultivées. Actuellement le CNRGV gère plus de 6 millions d’échantillons répartis dans prés de 90 banques génomiques de plantes modèles et cultivées : M. truncatula, A.thaliana, Blé, Vigne, Piment, Colza, Tournesol, Orge, Tabac, Melon, Radis, Maïs, Pomme de terre, Lépidoptère.
- Diffuser les échantillons biologiques et données associées
- Produire et diffuser des «outils génomiques » et des prestations de services (Construction de Banques BACs spécifiques, Production et criblage de Macroarrays, Production et criblages de Pools d’ADN, Services robotiques à façon)
- Formations (gestion des collections génomiques et contrôle qualité)

Les collections

90 banques génomiques
22 espèces différentes

L'ensemble de nos banques sont disponibles sur notre site internet :
http:// cnrgv.toulouse.inra.fr

Arabidopsis :
Banque ADNc Aeu-C-INT
Banque ADNc Aeu-C-MY
Banque BAC Aha-B-HF11
Banque BAC Aha-B-L406
Banque BAC Aha-B-PL22_138
Banque BAC Aly-B-03A7
Banque BAC Aly-B-05B17
Banque BAC Aly-B-05B37_
Banque BAC Aly-B-05B8
Banque BAC Ath-B-GE
Banque BAC Ath-B-ITA3
Banque BAC Ath-B-TPI
Banque BAC Ath-B-TPT
Banque EST Ath-E-Entry 4
Banque EST Ath-E-FB
Banque EST Ath-E-LS
Banque EST Ath-E-PGH
Banque EST Ath-E-polC
Banque EST Ath-E-SIL
Orféome Ath-O-ATOME1
Orféome Ath-O-ATOME2

Colza :
Banque BAC Bna-B-darmor
Banque BAC Bna-B-I
Banque EST Bna-E-I
Banque EST Bna-E-II

Piment :
Banque BAC Can-B-I
Banque BAC Cin-B-S2

Melon :
Banque BAC Cme-B-I

Tournesol :
Banque BAC Han-B-Genoplante
Banque BAC Han-B-INP
Banque BAC Han-B-XRQ

Orge :
Banque BAC Hvu-B-ALLhA
Banque BAC Hvu-B-ALLhB
Banque BAC Hvu-B-ALLrA
Banque BAC Hvu-B-CHORI
Banque BAC Hvu-B-EcoK3
Banque BAC Hvu-B-HVMBb

Medicago truncatula :
Banque BAC Mtr-B-F83
Banque BAC Mtr-B-I
Banque BAC Mtr-B-II
Banque BAC Mtr-B-III
Banque BAC Mtr-B-IV
Banque BAC Mtr-B-WTSI
Banque EST Mtr-E-ADVT
Banque EST Mtr-E-BDVT
Banque EST Mtr-E-CDVT
Banque EST Mtr-E-PR
Banque EST Mtr-E-SCF
Banque EST Mtr-E-SC4
Banque EST Mtr-E-SNF
Banque EST Mtr-E-SN0
Banque EST Mtr-E-SN4
Banque EST Mtr-E-STA
Banque EST Mtr-E-STW

Tabac :
Banque EST Nta-E-[id.]

Phytospora parasita :
Banque BAC Ppa-B-I

Radis :
Banque BAC Rsa-B-I

Tomate :
Banque BAC Sce-B-Blanco
Banque BAC Sly-B-EcoRI
Banque BAC Sly-B-Hba
Banque BAC Sly-B-MboI
Banque BAC Sly-B-SL_EcoRI
Banque Fosmide Sly-F-FOS1

Blé:
Banque BAC Tae-B-CS
Banque BAC Tae-B-renan
Banque BAC Tae-B-1ALhA
Banque BAC Tae-B-1AShA
Banque BAC Tae-B-3B
Banque BAC Tae-B-3BFhB
Banque BAC Tae-B-3BMTP
Banque BAC Tae-B-3DLhA
Banque BAC Tae-B-3DShA
Banque BAC Ttu-B-LDN65

Vigne :
Banque BAC Vvi-B-CS
Banque BAC Vvi-B-PN4002

Maïs :
Banque EST Zma-E-I

Systeme informatique - Banque de donnees

- Un système de gestion d’information de laboratoire (LIMS) : GENOLIMS. Cette application centralise les informations relatives aux collections conservées par le CNRGV et assure la traçabilité des manipulations qui sont réalisées sur ces collections. Cette application repose sur une base de données et un serveur d’applications Oracle 10g, et les développements sont réalisés en JAVA J2EE.
- Un système de gestion des produits, matériels et consommables : GIMACO. Tous les produits, matériels et stocks des consommables du CNRGV sont gérés grâce à cette application développée au CNRGV, et aujourd’hui diffusée dans d’autres laboratoires. L’évolution de GIMACO nous a permis d’intégrer des éléments du Système de Management de la Qualité pour en simplifier et surtout optimiser le suivi. Les développements sont réalisés en PHP et les données sont stockées dans une base de données PostgreSQL 8.
- Un site Internet : principale interface de communication avec les laboratoires extérieurs. Ce site Web, développé sous le CMS (Content Management System) eZpublish, interagit au travers de « service Web » avec GENOLIMS pour diffuser certaines informations de la base de données du LIMS. La base de données utilisée pour le site est PostgreSQL 8 et le CNRGV développe en PHP des extensions eZpublish spécifiques à ses besoins.

Galerie

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