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Plate-forme : MaP, (Marseille Protéomique)
Ville : Marseille
Thématique : Protéomique

 
Présentation et prestations de la plate-forme
La plate-forme MaP (Marseille Protéomique) est issue de la volonté de quatre plates-formes de service et de
recherche de l’agglomération marseillaise de fonctionner de façon synergique dans le domaine de l’analyse protéomique (IFR11, IFR 88, IFR 137, Plateau protéomique de la Timone). Cette volonté n’est pas récente dans la mesure où la plupart de ces plates-formes font déjà partie de structures régionales comme Marseille-Nice Génopole® et le Cancéropole PACA. La création de MaP marque une étape d’intégration supplémentaire qui doit conduire à une meilleure visibilité et à l’émergence d’une entité susceptible de mieux répondre à des projets scientifiques ambitieux grâce à la complémentarité scientifique et technique des différents sites.

La plate-forme MaP présente une localisation multiple avec du matériel spécifique sur chacun des sites

Les prestations offertes sont :

Analyse de protéines par spectrométrie de masse MS et MSMS
- masse entière
- identification PMF ou MSMS
- quantification iTRAQ
- analyse des modifications post-traductionnelles
- séquençage de novo
- interactions non covalentes

Profiling protéiques par Seldi-TOF

Pharmacoprotéomique
- dosage
- pharmacocinétique
- identification de métabolites

2D-DiGE

Identification et analyse des interactions protéiques par criblage double-hybride chez la levure

Caractérisation des interactions moléculaires
- cinétiques des interactions moléculaires par SPR (Biacore)
- « Ligand fishing », couplage SPR/MS
- Analyse thermodynamique par microcalorimétrie
- Analyse des complexes macromoléculaires par ultracentrifugation analytique

Séquençage d'Edman
Autres éléments
Certification ISO 9001non
Site web de la plate-formehttp://map.univmed.fr
Structure(s) de rattachementUniversité de la Méditerranée
Réseaux auxquels participe la plate-forme- Réseaux Biomarqueurs – Patrick Ducoroy, A Gonçalves, INCa
- Réseau européen Nano (D.Braguer)
- Cancérople
Moyens et équipements de la plate-forme
Principaux équipements :

Site IFR 11 Jean Roche
- Biacore 3000(SPR) (2000)
- Spectromètre de masse Q-ToF Ultima (Waters-Micromass) couplé à une nanoLC CapLC XE (Waters) (2004)
- Spectromètre de masse MALDI ToF/ToF Ultraflex II (Bruker) (2005)

Site IFR 88 IMM
-Spectromètre de masse Trappe à Ions LCQ DECA XP plus (ThermoFinnigan) couplé à une HPLC Surveyor (2003)
- microséquençeur N-terminal de protéines Procise 494 (Applied Biosystems) (2002)
- Spectromètre de masse MALDI-ToF (2008)
-Free Flow Electrophoresis (2009)

Sites IFR137 (ICIM)
Profiling :
- Seldi-Tof série 4000, Ciphergen-Bio-rad, 2006

Protéomique analytique* :
- Maldi-Tof MS UltraFlex, Bruker, 2002
- nanoLC-Trappe à ions HCT, Dionex-Bruker, 2003
* Ces équipements destinés à l’identification de protéines sont implantés au CIML.

Site Timone :
- MALDI Tof-Tof axima shimadzu avec nanospotter
- Trappe ionique deca XP+ (thermofinnigan) couplée à un système chromatographique Ettan MDLC,
- Electrospray hybride quadrupole temps de vol (Bruker) couplé à une chromatographie haute pression Agilent,
- MALDI ToF Ettan Pro (Amersham).
- trois microcalorimètres isotherme auto ITC 200 et VPITC et à dénaturation thermique VPDSC
- Ultracentrifugeuse analytique Beckman XLA
Coordonnées et contact sur la plate-forme
Nom Plate-FormeMaP, (Marseille Protéomique)
Responsable ScientifiqueBORG/BOUGIS/LAFITTE/MEUNIER-GONTERO
Responsable TechniqueAUDEBERT/BELGHAZI/FOURQUET/LEBRUN/VILLARD
Adresse PostaleMaP (Claude Roux)
CRCM, Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille U891INSERM
27, Boulevard Lei Roure
13009 Marseille
Site web de la plate-formehttp://map.univmed.fr
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