Annuaire des Plate-formes IBiSA
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| Présentation et prestations de la plate-forme | La Plate-forme de Protéomique (PfP) de l'IFR23 est un réseau de compétences mutualisant des moyens d'enseignement, de recherche, des ressources technologiques et de l’information. La PfP est localisée à l'Université de Rouen, principalement dans les locaux de la Faculté des Sciences. Une extension existe au niveau de la Faculté de Médecine-Pharmacie. La PfP comprend 5 services (électrophorèse, chromatographie, spectrométrie de masse, séquençage peptidique et biophysique) et est ouvert aux 18 équipes fondatrices de l'IFRMP 23, ainsi qu'aux autres équipes de recherche nationales et internationales. La PfP est sous la responsabilité d'un responsable scientifique (Thierry Jouenne, DR CNRS) et d'un responsable Technique (Pascal Cosette, MCU), et est administrée par un comité de pilotage et un comité scientifique dont les compositions sont données sur le site web (http://plateforme-proteomique.crihan.fr ). La Plate-forme a été et est directement impliquée dans plusieurs programmes ANR (programmes ENAPACAP, GLYCO-CHLOROPLAST, SURFANBAC, BACCIO, ...), CNRS (ECoC2) et dans des programmes internationaux : programme ERA-NET Pathogenomics EPS-MATRIX, Programme COST, Programme de Coopération CNRS-DGRSRT Tempus (Tunisie). Deux programmes FEDER Interreg 3A ont été, ou sont actuellement menés en collaboration avec l'Université de Brighton (GB) : programmes AMACOM et APROBIO. La PfP entretient aussi de nombreuses collaborations internationales (Afrique du Sud, Emirats Arabes Unis, Canada, Grande-Bretagne, Japon, Pays-Bas, Portugal, Tunisie, USA, ...) et développe un partenariat important avec des entreprises privées dans le domaine de la purification et identification de peptides et protéines. La PfP est impliquée dans plusieurs réseaux (PNIR CNRS « Biofilm » (http://www.biofilms-pnir.org/fr ), Cancéropole Nord-Ouest (http://www.canceropole-nordouest.org ), réseau LARC-Nneurosciences) et Réseau Biomarqueurs d’Etat Pathologique (RéBEP). Depuis 2009, elle a intégrée le Pôle de Compétitivité Cosmetic valley. Une part importante de l'activité des chercheurs et Ingénieurs de la PfP est aussi consacrée au développement technologique (mise au point d’un LIMS, recherche de nouveaux fluorophores, élaboration de nanobilles magnétiques).
La PfP est également fortement impliquée dans la formation initiale, doctorale et permanente. Ainsi les étudiants et doctorants rouennais bénéficient d'un accès privilégié à la PfP pour mener à bien leurs projets de recherche. La PfP est aussi fortement impliquée dans le PPF Nouveaux outils pour un protéome ciblé qui a été créé lors de vague de contractualisation 2009-2013 (resp. Pascal Cosette). | | Autres éléments | | Certification ISO 9001 | non | | Site web de la plate-forme | http://plateforme-proteomique.crihan.fr | | Structure(s) de rattachement | Université de Rouen | | Réseaux auxquels participe la plate-forme | Cancéropole Nord-Ouest, LARC-neurosciences, REBEP 3 , GDR 3171, réseau national Biofilm, Pole de compétitivité Cosmetic valley |
| Moyens et équipements de la plate-forme | Séparation des protéines : Appareil couleur de gels a2DEoptimizer (Nextgensciences), 7 bancs d’électrophorèse bi-dimensionnelles, Dodeca cell, Ettan DALTsix, un système ProteomeLab™ PF 2D(Beckman))
Excision et digestion, dépôt : Spot Picker (Amersham, Pharmacia), ProXcision (Perkin Elmer), Multiproble II Plus (PerkinElmer), Janus (Perkin Elmer),Biomek3000 (Beckman), Ettan™Digester(Amersham)
Analyse d’images : Fluoroimageur (DIGE) ProXpress (Perkin Elmer), 2 Densitomètres GS700 et GS800 (BioRad) , Logiciels ProFinder , Melanie 4 et PDQuest
Identification :2 séquenceurs N-terminaux: Procise 492 et Procise 494 (Applied Biosystem), Cinq spectromètres de masse: MALDI-Tof prOTOF 2000 (Perkin Elmer, acquis en Septembre 2005), Couplage nanoLC-MS/MS LCpackings-Q-TRAP(Applied Biosystem, acquis en janvier 2007 ), nanoLC-chip-MSMS Agilent 6340 (acquise en décembre 2006, système 6520 Accurate-masse Q-TOF (LC/MS) (Agilent, acquis en Avril 2008), couplage électrophorèse capillaire –Trappe ionique Esquire 3000 (Bruker) (acquise en Octobre 2003), nanoLC U3000 (couplée avec Microsystème Robotique PROBOT (Dionex, acquis en Juin 2007))
Traitement et Gestion des données : version locale du moteur de recherche MASCOT, module ProQuant (Applied Biosystem) inséré dans la suite Analyst, PrIMS (Proteomic Information Management System)
Analyse structurale : Appareil de dichroïsme circulaire CD6 Jobin –Yvon
Biophysique : 2 Stands de reconstitution en bicouche lipidique, patch clamp
Biacore, |
| Galerie d'images de la plate-forme | |
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