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PISSARO
Responsable : Pascal COSETTE • Responsable Tech. : Thierry Jouenne (20 %) David Vaudry (25 %)
Adresse : Plateforme Protéomique PISSARO
Université de Rouen
Faculté des Sciences de Rouen
Boulevard Maurice de Broglie
76821 Mont-Saint-Aignan

complements

Certifications

  

Site web

http://plateforme-proteomique.crihan.fr

Presentation de la plate-forme

La plateforme protéomique PISSARO est localisée à l'Université de Rouen et a été créée dans le cadre de l'Institut de recherches et d'innovation Biomédicales (IRIB). PISSARO est un réseau de compétences mutualisant des moyens de recherche, des ressources technologiques et d’information dans le domaine de la protéomique et aussi d'enseignement et de formation. PISSARO s’est inscrit de nombreuses années dans la démarche qualité et a obtenu les certifications ISO9001 et NF X50-900.
La plateforme comprend 3 services (chromatographie & spectrométrie de masse, électrophorèse, séquençage peptidique) et est ouvert aux 17 Unités de Recherche impliquées dans l’IRIB, ainsi qu'aux équipes de recherche nationales et internationales. PISSARO est sous la responsabilité d'un directeur scientifique (Pascal Cosette, Pr Univ), d’un directeur adjoint (David Vaudry, CR INSERM) et d’un directeur administratif (Thierry Jouenne, DR CNRS) et est administrée par un comité de pilotage et un comité scientifique. Le site de la plateforme est actuellement en reconstruction (http://plateforme-proteomique.crihan.fr).
La Plate-forme est impliquée sur divers programmes de recherche nationaux et internationaux. PISSARO entretient de nombreuses collaborations internationales (Royaume Uni, Emirats Arabes Unis, Canada, Japon, Portugal, Tunisie, USA, ...) et développe un partenariat important avec des entreprises privées dans le domaine de la purification, de l‘identification et de la quantification et identification de peptides et protéines. Depuis 3 ans, PISSARO est « Associated Lab » de la société Agilent.
PISSARO est impliquée dans plusieurs réseaux comme la Cancéropole Nord-Ouest ou le réseau LARC-Neurosciences. Depuis 2009, elle a intégré le Pôle de Compétitivité Cosmetic valley et depuis 2016, l’Institut Tremplin Carnot I2C.
Une part importante de l'activité des chercheurs et Ingénieurs de PISSARO est consacrée à des prestations de services et de la recherche collaborative ainsi qu’à des développements technologiques concernant la quantification de biomarqueurs, la recherche de modifications post-traductionnelles, la caractérisation d’anticorps thérapeutiques, le design de nouveaux fluorophores ou encore l’élaboration de nanobilles magnétiques).
PISSARO est également fortement impliquée dans la formation initiale, doctorale et permanente. Ainsi les étudiants et doctorants rouennais, mais aussi de l’extérieur bénéficient d'un accès privilégié à la plateforme pour mener à bien leurs projets de recherche. PISSARO est aussi impliquée dans la formation dispensée par l’école d'ingénieur ESITECH depuis maintenant 3 ans.

Moyens et equipements

Séparation des protéines :
Sept bancs d’électrophorèse bidimensionnelle, Dodeca cell, Ettan DALTsix, Appareil couleur de gels a2DEoptimizer (Nextgensciences),
Excision et digestion :
Spot Picker (Amersham, Pharmacia), ProXcision (Perkin Elmer), Multiproble II Plus (PerkinElmer), Janus (Perkin Elmer), Biomek3000 (Beckman), Ettan™Digester(Amersham)
Analyse d’images :
Fluoroimageur (DIGE) ProXpress (Perkin Elmer), 2 Densitomètres GS700 et GS800 (BioRad), Logiciels Samespots, ProFinder et PDQuest
Identification des protéines :
Sept spectromètres de masse : MALDI-TOFTOF (Bruker), nanoLC-chip-IT 6340 (Agilent), nanoLC-chip-QTOF 6520 (Agilent), nLC proxeon-Orbitrap Elite (Thermo Scientific), nanoLC-chip-QQQ 6490 (Agilent), nRSLC-QExactive plus (Thermo Scientific)
Deux séquenceurs N-terminaux : Procise 492 et Procise 494 (Applied Biosystem)
Chromatographie
nLC U3000 couplée avec Microsystème Robotique PROBOT (Dionex), système ProteomeLab™ PF 2D (Beckman), Système AKTA (GE HealthCare), nanoLC Ultimate3000,
Traitement des données :
MASCOT, Proteome Discoverer, Progenesis QI, Proteome Discoverer, Peaks, Spectrum Mills, Ingenuity

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