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PRIMACEN
Responsable : Dr David Vaudry • Responsable Tech. : Dr Ludovic Galas (100%, RIO 2003)
Adresse : Plate-forme régionale de Recherche en IMAgerie CEllulaire de Normandie (PRIMACEN), Institut de Recherche et d'Innovation Biomédicale (IRIB), Bâtiment CURIB, Faculté des Sciences et Techniques, Université de Rouen, 25 rue Lucien Tesnière
76821 Mont-Saint-Aignan

complements

Certifications

Pas de certification ISO

Site web

http://primacen.fr

Presentation de la plate-forme

La Plate-forme régionale de Recherche en IMAgerie CEllulaire de Normandie (PRIMACEN) regroupe quatre services qui couvrent un large spectre d’activités dans le domaine de l’imagerie cellulaire depuis la synthèse de biomarqueurs et la préparation des échantillons jusqu’à la localisation et la détermination de l’activité biologique d’une molécule d’intérêt. Les offres relatives à chacun des services concernent les champs d’application suivants :

• Service de synthèse de peptides et criblage fonctionnel
Responsable : Dr Jérome Leprince (CR Inserm)
Co-responsable Dr Christophe Dubessy (MCU Université de Rouen)
Acteur : Benjamin Lefranc (IE Inserm)
Les études menées à partir des équipements du service de Synthèse de Peptides et Criblage Fonctionnel consistent d’une part à synthétiser, purifier, analyser et caractériser des peptides, analogues peptidiques ou biomarqueurs et d’autre part à identifier et déterminer l’activité biologique de molécules naturelles ou de synthèse.
La principale question abordée porte sur l'étude des relations structure-activité de peptides biologiquement actifs, mais le domaine d'activité du service couvre toutes les recherches propres aux différentes équipes de l'IRIB ou aux clients extérieurs comme par exemple la fourniture de peptides et pseudo-peptides d'intérêt y compris la synthèse d'antigènes permettant le développement d'anticorps qui sont utilisés pour l'imagerie par immunohistochimie. Les prestations du service couvrent également le domaine d'application de la spectrométrie de masse MALDI-TOF pour l'analyse de peptides naturels contenus dans des échantillons biologiques et la protéomique par exemple. Le service est à même de synthétiser des peptides naturels, de concevoir et synthétiser des peptides modifiés (analogues stables, peptides biotinylés, peptides fluorescents, peptides marqués à l'iode 125), de les purifier, de les caractériser, et de les conditionner à des fins de recherche académique ou privée à l'exclusion des protocoles d'administration chez l'Homme. Les tests fonctionnels sont effectués sur des cultures de lignées cellulaires et des cultures primaires par des techniques de spectrofluorimétrie. Les tests biologiques proposés sont par exemple la mesure de variations de la [Ca2+]i, d'AMPc, de potentiel membranaire, d'activités enzymatiques ou encore de survie cellulaire. Ils sont réalisés par des approches à faible et moyen débit, soit au niveau d'une cellule unique soit au niveau d'une population cellulaire, en fonction du nombre d'échantillons à analyser et du type de problème à résoudre.

• Service de Bio Imagerie Photonique
Responsable : Dr Ludovic Galas (IR Inserm, RIO)
Co-responsable : Dr Magalie Bénard (IR Inserm RIO)
Acteurs : Mr Damien Schapman (IE Université), Mr Alexis Lebon (IE Inserm), Dr Delphine Burel (MCU Université).

La stratégie du service de Bio-Imagerie Photonique est de proposer des équipements de microscopie (champ large, à ondes évanescentes, confocale, gated STED, biphotonique), des équipements de macroscopie (champ large et confocale) et des scanners (visible, infra-rouge) afin de couvrir un large spectre de résolutions multidimensionnelles. Les échantillons, d'origine végétale, animale ou humaine, peuvent être observés fixés ou vivants dans des configurations in vitro, ex vivo ou in vivo. Les études menées à partir des équipements de ce service ont pour finalité la localisation et le suivi de l'expression (immunohistochimie, immunocytochimie, hybridation in situ) de molécules d'intérêt (neurotransmetteurs, neuropeptides, protéines, enzymes...) et de sites de liaison/récepteurs au sein d'organismes, de tissus et de cellules. En utilisant des protéines de fusion ou des sondes/marqueurs fluorescents, la localisation et le rôle de ces molécules d'intérêt sont également étudiés sur des organismes, des tissus et des cellules vivants. Ces approches technologiques rendent possible l'étude spatio-temporelle des processus biologiques comme la migration, la communication, la différenciation, la survie/mort cellulaire mais aussi le suivi des variations de [Ca2+]i, de potentiel membranaire et d'activités enzymatiques. Le service propose également des solutions d'analyse d'images incluant le tracking, la déconvolution et la reconstruction 3D pour le traitement en post-acquisition des données.

• Service de microscopie électronique
Responsables : Dr Sophie Bernard (IE Université de Rouen)
Acteurs : Dr Marie-Laure Follet-Gueye (MCU Université de Rouen)
Les études menées à partir des équipements du service de microscopie électronique concernent la localisation et l'identification à l'échelle subcellulaire de molécules d'intérêt par immunocytochimie dans des cellules humaines, animales, végétales et bactériennes. Le service dispose de différents appareils permettant de mettre en œuvre de très nombreuses techniques dans le domaine de la microscopie électronique (cryofixation haute-pression, immunocytochimie, ultramicrotomie à froid et à température ambiante...). Le service possède aussi un savoir-faire important sur les échantillons végétaux, animaux et bactériens...

• Service de microdissection et de PCR quantitative
Responsable : Dr David Vaudry (CR Inserm)
Co-responsable : Dr Magalie Bénard (IR Inserm, RIO)
Acteurs : Dr Arnaud Arabo (IE Université de Rouen), Dr Magali Basille-Dugay (IR Université de Rouen), Mme Julie Maucotel (Tech, Université de Rouen), Mme Caroline Theresine (Apprentie Inserm).
Au sein du service de microdissection laser et de PCR quantitative, vous trouverez tous les équipements nécessaires pour réaliser des analyses histologiques. Les études menées à partir des équipements du service permettent de quantifier l'expression relative de gènes exprimés dans différents tissus ou dans des cellules en culture. Les appareils disponibles permettent de réaliser des interventions chirurgicales pour traiter les animaux puis des coupes histologiques des tissus d’intérêt avec un microtome, cryomicrotome ou vibratome. Ce service s'est aussi doté de deux appareils de microdissection laser pour récupérer au sein des tissus des zones d'intérêt. Le service propose également l'extraction des ARN, la distribution robotisée des plaques pour les analyses transcriptomques et la réalisation des PCR en formats 96 et 384 puits. Afin de pouvoir étudier des processus biologiques particuliers, le service a développé des panels thématiques (inflammation, stress oxydatif, apoptose, cycle cellulaire, angiogénèse…) et en collaboration avec le service commun de protéomique de l'IRIB, il est aussi possible de conduire des analyses protéomiques.

En plus des prestations offertes par les 4 services cités ci-dessus, PRIMACEN réalise le développement d'applications informatisées (Alexis Lebon, Ludovic Galas, David Vaudry, Magalie Bénard) dans différents domaines avec des cibles locales, régionales, nationales et internationales:
- communication, gestion de publications et de livrables
Cible : SFR, Réseaux scientifiques, Projets Interreg
7 sites web : IRIB, TNT-Club, MicroLaser, LARC-Neurosciences, TC2N, PeReNE, AlcoBinge
- gestion adaptée aux plateformes de recherche (Réservation, Facturation, Bilan, Métrologie, Documentation qualité...)
Cible : 150 utilisateurs du secteur public & privé
Nom du site web : iPRIMACEN
- gestion dynamique du patrimoine et des ressources Immobilières avec support
Cible : 200 utilisateurs issues de la recherche bioloique & biomédicales ; 15 entités (Inserm, CNRS, Université)
Nom du site: EasyLab-Manager, UFR ST univ Rouen
- gestion et inventaire des risques rencontrés dans les activités de recherche avec cartographie intéractive & édition en ligne des documents réglementaires.
Cible : 10000 agents Inserm et ouvert à la mixité ; 350 unités et plateformes
Noms des sites : LabRisk, AGIR (Prix Innovation Inserm 2017)
Départements : BCPR & DSI Inserm
- gestion de congrès avec inscriptions, soumission en ligne avec export automatisé
Cible : Workshop, congrès national et international (1000 participants)
Evènements : ICN2010, SFEAP2012, RegPep2016, Journées LARC, JNRb, SympoIRIB, iPRIMACEN ' Event

Moyens et equipements

Service de synthèse de peptides et criblage fonctionnel :
3 Synthétiseurs de peptides (2006,2010, 2019), 4 HPLC Gilson et Agilent (1999, 2007, 2010), 2 lyophilisateurs (2001, 2011) et 2 spectromètre de masse MALDI-TOF (2003, 2018).
Flexstation III Molecular device (2018), lecteurs de plaques Biotek et Perkin Elmer (2000, 2007).

Service de Bio Imagerie Photonique :
Microscope confocal droit fixed stage SP8 MP Leica avec une laser pulsé infra-rouge (Chameleon, Coherent) (2012 et upgrades réguliers), Microscope confocal inversé gated STED SP5 X avec laser blanc (2008, 2012), Macroscope confocal/wide-field LSI (2009 et upgrades réguliers), Vidéomicroscope Leica et module TIRF multicouleurs (2008 et upgrade 2012), Biostation Nikon (2009), Système automatisé wide-field CellDiscoverer 7 (CD7) Zeiss (2019), laboratoire L2 (2017).
Systèmes de microscopie wide-field bright/dark field, épifluorescence (Explora Nova/Nikon 2006, 2012), Système de microscopie Axioscope 7 Zeiss (2019), Macroscope Leica bright/dark field (2005, 2010), Scanner infra-rouge Odyssey LI-COR (2010), Système complet d’analyse d’image Imaris (2007 et upgrade réguliers), Système de déconvolution Huygens Professional (2014 et upgrades réguliers).

Service de microscopie électronique
Cryofixateur haute pression HPM100 Leica (2013), Automate de cryosubstitution AFS2 Leica (2012), Ultramicrotome UC6 Leica (2008), Cryo-ultramicrotome UC7 Leica (2018), Microscope électronique à transmission Tecnai 12 FEI (2000).

Service de microdissection laser et Q-PCR :
2 Cryotomes LEICA 3050 et CM1950(1996, 2008), 1 Cryomicrotome Thermo NX70 (2018), 2 Vibratomes LEICA VT1000 (1999, 2018), 1 Microdissecteur laser PALM/Zeiss (2005), 1 Microdissecteur Leica (2009), 3 Appareils PCR quantitative (2007, 2011, 2019), 1 Robot Agilent Bravo (2011), deux postes pour la chirurgie (2007, 2012).

Galerie

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