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PRIMACEN
Responsable : Dr David Vaudry • Responsable Tech. : Dr Ludovic Galas
Adresse : Plate-forme régionale de Recherche en IMAgerie CEllulaire de haute-Normandie (PRIMACEN),Institut Fédératif de Recherches Multidisciplinaires sur les Peptides (IFRMP 23), Place Emile Blondel, Faculté des Sciences, Université de Rouen
76821 Mont-Saint-Aignan

complements

Certifications

Pas de certification ISO

Site web

http://primacen.fr

Presentation de la plate-forme

La Plate-forme régionale de Recherche en IMAgerie CEllulaire de haute-Normandie (PRIMACEN) regroupe quatre services qui couvrent un large spectre d’activités dans le domaine de l’imagerie cellulaire depuis la synthèse de biomarqueurs et la préparation des échantillons jusqu’à la localisation et la détermination de l’activité biologique d’une molécule d’intérêt. Les offres relatives à chacun des services concernent les champs d’application suivants :

•service de synthèse de peptides et criblage fonctionnel
Responsable : Dr Jérome Leprince (CR Inserm)
Co-responsable Dr Christophe Dubessy (MCU Université de Rouen)
Acteur : Benjamin Lefranc (IE Inserm)
Les études menées à partir des équipements du service de Synthèse de Peptides et Criblage Fonctionnel consistent d’une part à synthétiser, purifier, analyser et caractériser des peptides, analogues peptidiques ou biomarqueurs et d’autre part à identifier et déterminer l’activité biologique de molécules naturelles ou de synthèse.
La principale question abordée porte sur l'étude des relations structure-activité de peptides biologiquement actifs, mais le domaine d'activité du service couvre toutes les recherches propres aux différentes équipes de l'IRIB ou aux clients extérieurs comme par exemple la fourniture de peptides et pseudo-peptides d'intérêt y compris la synthèse d'antigènes permettant le développement d'anticorps qui sont utilisés pour l'imagerie par immunohistochimie. Les prestations du service couvrent également le domaine d'application de la spectrométrie de masse MALDI-TOF pour l'analyse de peptides naturels contenus dans des échantillons biologiques et la protéomique par exemple. Le service est à même de synthétiser des peptides naturels, de concevoir et synthétiser des peptides modifiés (analogues stables, peptides biotinylés, peptides fluorescents, peptides marqués à l'iode 125), de les purifier, de les caractériser, et de les conditionner à des fins de recherche académique ou privée à l'exclusion des protocoles d'administration chez l'Homme. Les tests fonctionnels sont effectués sur des cultures de lignées cellulaires et des cultures primaires par des techniques de spectrofluorimétrie. Les tests biologiques proposés sont par exemple la mesure de variations de la [Ca2+]i, d'AMPc, de potentiel membranaire, d'activités enzymatiques ou encore de survie cellulaire. Ils sont réalisés par des approches à faible et moyen débit, soit au niveau d'une cellule unique soit au niveau d'une population cellulaire, en fonction du nombre d'échantillons à analyser et du type de problème à résoudre.

•service de Bio Imagerie Photonique
Responsable : Dr Ludovic Galas (IR Inserm, RIO)
Co-responsable : Dr Magalie Bénard (IR Inserm RIO)
Acteurs : Mr Damien Schapman (IE Université), Mr Alexis Lebon (IE Inserm).

La stratégie du service de Bio-Imagerie Photonique est de proposer des équipements de microscopie (champ large, à ondes évanescentes, confocale, gated STED, biphotonique), des équipements de macroscopie (champ large et confocale) et des scanners (visible, infra-rouge) afin de couvrir un large spectre de résolutions multidimensionnelles. Les échantillons, d'origine végétale, animale ou humaine, peuvent être observés fixés ou vivants dans des configurations in vitro, ex vivo ou in vivo. Les études menées à partir des équipements de ce service ont pour finalité la localisation et le suivi de l'expression (immunohistochimie, immunocytochimie, hybridation in situ, binding, Western in cell) de molécules d'intérêt (neurotransmetteurs, neuropeptides, protéines, enzymes...) et de sites de liaison/récepteurs au sein d'organismes, de tissus et de cellules. En utilisant des protéines de fusion ou des sondes/marqueurs fluorescents, la localisation et le rôle de ces molécules d'intérêt sont également étudiés sur des organismes, des tissus et des cellules vivants. Ces approches technologiques rendent possible l'étude spatio-temporelle des processus biologiques comme la migration, la communication, la différenciation, la survie/mort cellulaire mais aussi le suivi des variations de [Ca2+]i, de potentiel membranaire et d'activités enzymatiques. Le service propose également des solutions d'analyse d'images incluant le tracking, la déconvolution et la reconstruction 3D pour le traitement en post-acquisition des données.

•service de microscopie électronique
Responsables : Dr Sophie Bernard (IE Université de Rouen)
Co-responsable : Dr Marie-Laure Follet-Gueye (MCU Université de Rouen)
Acteurs : Mlle Yasmina Ramdani (IE CDD Université de Rouen)
Les études menées à partir des équipements du service de microscopie électronique concernent la localisation et l'identification à l'échelle subcellulaire de molécules d'intérêt par immunocytochimie dans des cellules humaines, animales, végétales et bactériennes. Le service dispose de nombreux appareils permettant de mettrre en oeuvre de très nombreuses techniques dans le domaine de la microscopie électronique (cryofixation haute-pression, immunocytochimie, ultramicrotomie à froid et à température ambiante...). Le service posséde aussi un savoir-faire important sur les échantillons végétaux, mais aussi animaux et bactériens...

•service de microdissection et de PCR quantitative
Responsable : Dr David Vaudry (CR Inserm)
Co-responsable : Dr Magalie Bénard (IR Inserm, RIO)
Acteurs : Dr Magali Basille Dugay (IR Université de Rouen), Mme Di Giovanni (IE Université de Rouen).
Les études menées à partir des équipements du service de microdissection laser et de PCR quantitative consistent à quantifier l'expression relative de gènes exprimés dans différents tissus ou dans des cellules en culture. Les appareils disponibles permettent de réaliser des interventions chirurgicales pour traiter les animaux puis la découpe fine de structures d'intérêt dans des tissus par microchirurgie ou par microdissection laser. Le service propose aussi l'extraction automatisée des ARN, la distribution robotisée des plaques de PCR quantitative et l'analyse par PCR quantitative. La Plate-Forme dispose de 3 appareils de PCR quantitative permettant de travailler avec des plaques allant de 96 à 1536 puits et s'est équipée d'un robot de pipetage pour proposer le dépôt automatique des échantillons. Ce service s'est aussi doté de deux appareils de microdissection laser pour récupérer des tissus d'intérêt. En collaboration avec le service commun de protéomique de l'IRIB, il est aussi possible de conduire des analyses protéomiques. Au sein de ce service, vous trouverez tous les équipements nécessaires pour réaliser des analyses histologiques.

Moyens et equipements

Service de synthèse de peptides et criblage fonctionnel :
4 Synthétiseurs de peptides (1996, 2006,2010), 4 HPLC Gilson (1999, 2007, 2010), 3 lyophilisateurs (1998, 2001, 2011) et spectromètre de masse MALDI-TOF (2003).
Flexstation III Molecular device (2018), lecteurs de plaques Biotek et Perkin Elmer (2000, 2007) et cytomètre de flux Beckman Dickinson (1999).

Service de Bio Imagerie Photonique :
Microscope confocal droit SP2 AOBS Leica, (2002), Microscope confocal inversé SP2 AOBS avec de chaîne de laser multiphotonique et module FLIM (2003), Microscope confocal inversé SP5 X avec laser blanc et module TIRF multicouleurs (2008), Macroscope confocal LSI (2009), vidéomicroscopes Leica/Metamorph avec module de déconvolution (2001, 2003), Biostation Nikon (2009), Cell Vizio 488 (2009), microfluorimètre dédié à la détection de sondes calciques ratiomètriques Nikon (1997), laboratoire L2 (2008).
Système d’analyse d’images Explora Nova/Nikon (2002, 2006), système d’analyse d’images SAMBA pour l’autoradiographie (2002), phosphorimageur STORM Amersham (2000), Système d’analyse d’image Imaris (2007), macroscope Leica (2005).

Service de microscopie électronique
Microscope électronique FEI avec dispositif de fixation à haute-pression (2000), 1 système de substitution à froid (2003), 2 ultracryomicrotomes Leica (2000, 2008), évaporateur de carbone (2004), 1 knife maker Leica (2000), 1 automate pour l'immunogold Leica (2004).

Service de microdissection laser et Q-PCR :
4 Cryotomes REICHERT-JUNG, LEICA (1994, 1997, 2001, 2007 et 2008), 2 Vibratomes LEICA (1999), Microdissecteur laser PALM/Zeiss (2005, 2009), 3 Appareils PCR quantitative (2007, 2011), Robot Eppendorf (2004), appareil de PCR (2005), équipements pour la chirurgie (2005, 2007, 2008).

Galerie

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