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GENOMAX
Responsable : Raphael CARAPITO • Responsable Tech. : Anne Molitor
Adresse : Centre de Recherche d'Immunologie et d'Hématologie
4, rue Kirschleger
67085 Strasbourg

complements

Certifications

Pas de certification ISO

Site web

http://www.u1109.inserm.fr/content/genom...

Presentation de la plate-forme

1) Whole human genome re-sequencing
2) Whole exome sequencing (capture Sure Select® Agilent, TruSeq® Illumina or Ampliseq® ThermoFisher)
3) de novo sequencing of small genomes
4) Targeted sequencing: gene panels, viruses, somatic mutation hotspots (deep sequencing)
5) RNA-seq: whole transcriptome and small RNA
6) Copy number variations
7) Chip-seq
8) SNPs genotyping
9) Sanger sequencing
10) Metagenomics

Moyens et equipements

Séquenceurs de nouvelle génération:
- Ion PGM (ThermoFisher Scientific)
- Ion Proton (ThermoFisher Scientific)
- NextSeq500 (Illumina)
- Équipement pour la préparation de librairies: Covaris S220, Hydroshear, Library builder, One Touch, Ion Chef (Life Technologies).
- Deux clusters informatique (total: 10 serveurs,
108 cores, 224GB de RAM et 100TB de stockage)

Séquencage Sanger:
- séquenceur à 16 capillaires (ABI3130XL, ThermoFisher Scientific)
- séquenceur à 96 capillaires (ABI3730XL, ThermoFisher Scientific)

RT-PCR quantitative à haut-débit:
- Real time thermocycler Open array NT Cycler (ThermoFisher Scientific)
- Accufill (ThermoFisher Scientific)

Autre :
- 3 thermocycleurs (2x Veriti 96-well, 1x GenAmp 9700) (ThermoFisher Scientific)
- Q-RT PCR instrument (ABI7000, ThermoFisher Scientific)
- 2100 Bioanalyzer (Agilent)
- Nanodrop 2000c (Labtech)

Galerie

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