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IMAG'IC
Responsable : Florence Niedergang • Responsable Tech. : Pierre Bourdoncle
Adresse : Institut Cochin
22, rue Méchain
75014 Paris

Presentation de la plate-forme

- Assistance sur tous types de microscopes ainsi que sur le traitement d'images

- Formation pour l'autonomie sur tous types de microscopes ainsi que sur le traitement d'images.
Formations individuelles ou par groupe pour les logiciels ImageJ et Imaris

-Service de sauvegarde et d’archivage d’images : Cochin Image Database
https://imagerie.cochin.inserm.fr/

- Restauration d'images par déconvolution 3D en ligne (serveur) sur l'ensemble des microscopes. PSFs théoriques ou expérimentales

- Traitement et analyse d'images 3D+t : ImageJ, Imaris, MetaMorph, Matlab, Huygens
Création de macros à la demande, traitement par lot.

- Applications : TIRF, FRET, FRAP, Calcium (Fura-2 ou Fluo), Lame Virtuelle, Photo-activation PA-FP, photo-conversion PS-FP, photo-dommage, FISH, PALM, dSTORM.
Suivi cellulaire 24 - 48h

- Interactions hôte-pathogènes : microscopie à « pinning disk » dans laboratoire de confinement L3 avec accueil des équipes extérieures.

-Études sur tissus humain : microscopie à « spinning disk » dans laboratoire de confinement L2 avec accueil des équipes extérieures.

-Coupe épaisse de tissu : Humain en L2 ou murin / fixées / perfusées / techniques FRET Calcium

-Clarification d'organes

-Microscopie super-résolution : accompagnement de la préparation d’échantillon à la reconstruction et à la quantification des images super-résolues. dSTORM 3D multi-couleurs, PALM, sptPALM.

-ImageStreamX : imageur en flux pour cellules en suspension

- Microscopie in situ : multi-photons avec canner résonant 20 images/s, détection spectrale, système d'anesthésie (murin), milieu perfusé O2 pour coupes épaisses, SHG, lame virtuelle

- Plate-Forme certifiée ISO 9001 version 2008 délivré par l'ARFNOR en octobre 2012

Moyens et equipements

- Microscope électronique à transmission Jeol 1011 2007

- Microscopie super résolution
GSD 3D PALM dSTORM multi-couleurs 2015

- Imagerie en flux
ImageStreamX MKII 2013

- 3 Microscope confocaux
Microscope spinning disk in vivo lame virtuelle 2010
Microscope spinning disk in vivo lame virtuelle confinement L3 2011
Microscope spinning disk in vivo lame virtuelle confinement L2 2016

-Microscopie in situ
Microscope multi-photons Leica SP5 2006
plaque chauffante et système d'anesthésie Isoflurane (murin)
milieu perfusé O2 pour coupes épaisses
laser IR femto seconde + OPO : excitation multi-photon enter 690 et 1600nm
SHG (collagène I et IV, fibrogénèse, µtubules, sarcomères, os)

-Microscopie plein champ
Macroscopie fluorescence et colorants Nikon AZ100 motorisé 2010
Microscope TIRF FRAP FRET, TILL Photonics iMIC système double caméra EMCCD pour FRET 2009
3 Microscopes à champs larges épi-illumination pour échantillons vivants, lame virtuelle, déconvolution 3D 2003-2011
3 Microscopes à champs larges épi-illumination pour échantillons fixés, déconvolution 3D 2007-2013
loupe binoculaire pour fluorescence et colorants

- Analyses et traitements d'images
2 stations d'analyse et de traitement d'images (ImageJ MetaMorph Imaris Matlab Huygens)
1 station dédiée à la restauration d'images par déconvolution 3D (Huygens)

- Imprimante 3D : photopolymérisation

Galerie