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Protéomique
Responsable : Virginie REDEKER • Responsable Tech. : David Cornu Responsable technique Willy Bienvenut Coordinateur bio-informatique
Adresse : Plateforme de Protéomique P3S-SICaPS
Bâtiment 21
Avenue de la Terrasse
91190 Gif-sur-Yvette

complements

Certifications

Pas de certification ISO

Site web

http://www.i2bc.paris-saclay.fr/spip.php...

Presentation de la plate-forme

Plateforme P3S-SICaPS
Plateforme de Proteomique Paris-Saclay (P3S) / Service d'Identification et de Caractérisation des Protéines par spectrométrie de masse (SICaPS)

Ouverture de la plateforme en 2008
Label IBISA en 2009 (intégré au Pôle de Biologie Structurale et Protéomique IMAGIF du Centre de Recherche de Gif, champs d'activité initial "Biologie Structurale et Proteomique")

NIVEAUX D'OFFRE :
(1) Prestations : réalisation des expériences de préparation d'échantillons, d'analyse par spectrométrie de masse et traitement des données par les ingénieurs de la Plate-forme
(3) Collaboration : notamment pour les analyses complexes

PRESTATIONS PROPOSÉES : le détail des prestations est en ligne : http://www.i2bc.paris-saclay.fr/spip.php?article1187

Offres de prestations proposées :
1- Mesure de masse exacte de protéines en solution, avec ou sans dessalage
2- Digestion enzymatique et identification de protéines par MALDI-TOF-TOF (protéines purifiées ou en mélange simples)
3- Digestion enzymatique et identification de protéines par nanoLC-ESI-MS-MS TripleTOF ou Orbitrap (protéines en mélange complexes)

Analyses complexes réalisées (consulter la plate-forme):
- Identification et quantification relative sans marquage des protéines à partir de mélanges protéiques complexes (recherche de partenaires, comparaison de protéomes, …)
- Identification et caractérisation de modifications post-traductionnelles (phosphorylations, lipides, …) ou chimiques (pontages covalents ou autres)
- Etudes quantitatives ciblées

Spécificités scientifiques:
- Systèmes biologiques variés: bactéries, paramécie, Arabodopsis thalian (autres plantes), Levures, C. elegans, cellules de mammifères.
- Méthodes de protéomique fonctionnelle (modifications co- et post-traductionnelles) et structurale (surfaces d'interactions protéine-protéines et déterminants de surfaces d'assemblages protéiques)

Moyens et equipements

- nanoAquity/nanoLC-ESI-Q-TOF 1er (Waters) acquis en 2008
- nanoLC Proxeon -nanoESI LTQ-Orbitrap Velos-ETD (Thermo) acquis en 2011
- MALDI-TOF/TOF (5800 ABSCIEX) acquis en 2012
nanoLC RSLC (Dionex) -nanoESI-TripleTOF (4600 ABSCIEX) acquis en 2012
- Serveur d’analyse de données et moteur de recherche MASCOT associé, acquis en 2011, 2013 et 2014

Galerie

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