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PICT
Responsable : Laurent Maveyraud • Responsable Tech. : Virginie Nahoum
Adresse : Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale (IPBS)
CNRS – Université de Toulouse
205 route de Narbonne
31077 Toulouse

complements

Certifications

  

Site web

http://cribligand.ipbs.fr

Presentation de la plate-forme

- Systèmes biologiques analysés : systèmes cellulaires et étude de macromolécules et de leurs complexes avec des ligands.

- Méthodes utilisées et localisation des sous-plateformes :
1/ Criblage guidé par les structures tridimensionnelles : Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale (IPBS, UMR 5089 CNRS-Université Paul Sabatier), qui regroupe les plateaux techniques de RMN (A. Milon) et de bio-cristallographie (L. Mourey) ainsi qu’un plateau de modélisation moléculaire et de criblage virtuel (J. Czaplicki et L. Maveyraud).
2/ Criblage et caractérisations biophysiques : Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale.
3/Synthèse chimique, analyse, identification, purification des ligands : Laboratoire de Synthèse et Physicochimie de Molécules d'Intérêt Biologique (LSPCMIB, UMR 5068 CNRS-Université Paul Sabatier).
4/Ingénierie et Criblage d’Enzymes Originales : Laboratoire d’Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP, ICEO, UMR CNRS-INRA-INSA)

Mots-clés : synthèse chimique parallèle, purification, identification de ligands, diversité moléculaire, conception rationnelle de ligands, biophysique, biologie structurale, modélisation moléculaire, criblage virtuel, RMN, cristallographie des rayons X, enzymes optimisées, évolution moléculaire dirigée, métagénomique, chimiothèque.

Moyens et equipements

- Spectromètres RMN 500 MHz et 700 MHz pour l’étude d’échantillons biologiques liquide ou solide (2004). Un spectromètre 600 MHz équipé d’une cryosonde triple résonance (2004) associé à un passeur d’échantillon (2014). En outre, dans le cadre de projets innovants, sur dossier scientifique, nous pouvons obtenir du temps machine sur les infrastructures européennes et nationales.

- Stations robotisées pour la réalisation et l’observation/gestion d’essais de cristallisation (2009, 2014, 2015), station de transfert de liquide de type Biomek (Beckman, 2011) et diffractomètres RX : diffractomètre 4-cercles et diffractomètre pour l'analyse préliminaire directement dans les plaques de cristallisation (2008), accès aux synchrotrons nationaux et européens.

- Automates de synthèse en parallèle (2007), HPLC préparative LC-MS (2007).

- Analyse, purification et identification de composés biologiquement actifs à haute valeur ajoutée : HPLC analytique (2009), préparative, supercritique, chirale et non chirale (2013), SFC-MS (2013), SFC-PDA (2013), LC-MS (2013), LC-ELSD (2013), LC-PDA (2013). Spectromètre de masse MALDI-TOF (2009).

- Grappes de PC (96 CPUs, 264 cœurs, 4 GPU pour dynamique moléculaires µs) et serveurs de fichiers centralisés avec capacité de stockage de masse, avec l’ensemble des logiciels pour la modélisation moléculaire, dynamique moléculaire, RMN, diffusion aux petits angles et cristallographie (2010). L’ensemble de ces logiciels a été mis à jour et de nouveaux logiciels implémentés (QuickVina and Amber package, 2013). PICT a également accès au Centre National de calcul : CALMIP (540 nodes, 10800 cœurs).

- Caractérisation et criblage biophysique : - Microcalorimètre de titration isotherme (ITC, 2010), appareil de criblage de thermostabilité des protéines par fluorescence (DSF, 2010), systèmes de diffusion statique et dynamique de la lumière, couplés ou non à un système de chromatographie d’exclusion (DLS et SEC-MALLS, 2012), spectropolarimètre Jobin-Yvon (2013).

- Criblage d’acitivités enzymatiques : automates de picking de colonies, duplication de plaques de cultures, gridding sur gélose ou membranes : QPixII (Genetix, 2002) et K2 (KBiosystem, 2011), stations de transfert de liquide de type Biomek (Beckman, 2002) et Genesis RSP200 (TECAN, 2002), plateau analytique comprenant fluorimètre, dichroisme circulaire (JASCO, 2007), HPLC et LC-MS (Dionex, 2008), plateau de purification de protéines comprenant des systèmes de chromatographie ÄKTA (Pure, Xpress, Purifier, Prime)

Galerie

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