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Génomique fonctionnelle de C. elegans
Responsable : Jonathan Ewbank • Responsable Tech. : Maïté Carre-Pierrat (Lyon), Jérôme Belougne (Marseille)
Adresse : Centre d'Immunologie de Marseille-Luminy, case 906
13288 Marseille

complements

Certifications

Pas de certification ISO

Site web

http://www.ciml.univ-mrs.fr/technology/c...

Presentation de la plate-forme

La plateforme est partagée entre deux sites, à Lyon (http://ums3421.univ-lyon1.fr/) et Marseille. Elle est constituée d’un ensemble d’équipements et de ressources (banque de 14000 mutants C. elegans, banque ORFeome, banque pan-génome RNAi...) pour faciliter les approches expérimentales à grande échelle et/ou de génomique fonctionnelle chez C. elegans.
L'activité principale de la plateforme à Marseille est centrée autour du COPAS Biosort qui permet un tri à haute vitesse des nématodes en fonction de leur taille, de l’expression d’un gène rapporteur fluorescent ou même du profil d’expression le long du ver. La plateforme à Lyon offre un service de validation et distribution des mutants de C. elegans, et un service de modification génique (knock-in, knock-out) à partir de ces mutants, ou de novo utilisant les approches de CRISPR/Cas9.

Moyens et equipements

Chaque plateforme dispose d’un trieur de nématodes (COPAS Biosort), acquis en 2013 (Marseille) et 2007 (Lyon). Elles ont l'ensemble des équipements requis pour la culture de C. elegans (incubateurs réfrigérés, microscopes, etc) et pour sa transformation (système de micro injection, microscope inversée aux optiques Nomarski). La plateforme à Marseille a également un robot TECAN Genesis 150 (de 1999, acquis en 2009).

Galerie