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Plateforme Imag'IN de l'IUC
Responsable : Pr Pierre Brousset • Responsable Tech. : Dr François-Xavier Frenois Pourcentage de temps consacré à la plateforme : 100%
Adresse : Plateforme Imag'IN de l'IUC

Oncopôle Toulouse – Institut Universitaire du Cancer (IUC)
Laboratoire d'Anatomo-CytoPathologie
1, Avenue Irène Joliot Curie
31059 Toulouse Cedex 9, France
31059 Toulouse

complements

Certifications

Pas de certification ISO

Site web

http://www.imagin.univ-tlse3.fr/ImagIn

Presentation de la plate-forme

Les activités de la Plateforme Imag'IN de l'IUC sont basées sur les techniques de pathologie digitale. Nous proposons une solution complète et adaptable pour l'histopathologie expérimentale, l'acquisition et la reconstruction d'images à partir de lames histologiques entières (lumière transmise et fluorescence), la mise à disposition des images générées sur des serveurs de stockage pour téléconsultation et leur analyse anatomique et fonctionnelle (intelligence artificielle, exploration et fouille de données).

Les prestations de la Plateforme Imag'IN sont ouvertes à l'ensemble de la communauté scientifique (public et privé). Elles se déclinent autour de plusieurs activitées :
1- Prestation de services pour la collecte, la gestion et le traitement des tissus (fixation, inclusion, sectionnement, etc.).
2- Prestation de services pour le marquage tissulaire automatisé chromogènique ou fluorescent (cible unique ou multiplex / protéine, ARN, ADN).
3- Prestation de services pour la microscopie virtuelle en lumière transmise et en fluorescence (y compris confocale) et consultation d'images à distance.
4- Formation individuelle à la demande des utilisateurs et programmes de formation sur les logiciels d'analyse d'images orientés objet, les statistiques et l'exploration de données, suivis d'un accès à un système de réservation en ligne pour un accès libre à nos ressources informatiques une fois la formation terminée.
5- Recherche et développement axée sur les projets pour la mise en œuvre de techniques histologiques nouvelles et spécifiques et/ou le traitement d'images et l'analyse quantitative d'images à l'aide de techniques d'imagerie de lames entières et d'apprentissage automatique (machine-learning / deep-learning).

Toutes nos prestations peuvent être utilisés séparément, ou bien combinées, afin de bénéficier de l'ensemble de nos compétences.

Moyens et equipements

- 1 scanner 3DHISTECH Pannoramic Confocal
- 2 scanners 3DHISTECH Pannoramic 250 Flash fond clair + fluorescence
- 1 scanner 3DHISTECH Pannoramic 1000 fond clair (commande en cours)
- 1 scanner Zeiss AxioScan.Z1 fond clair + fluorescence
- 1 automate immunohistochimie Ventana Discovery Ultra
- 1 suite analyse image IndicaLabs Halo
- 1 suite analyse image DEFINIENS TissueStudio + Developper XD + ImageMiner
- 1 suite analyse image IMARIS Bitplane
- 4 tables anti vibrations passives
- Plusieurs solutions de stockage serveurs et de visualisation des lames virtuelles à distance (logiciels CaseCenter 3DHISTECH, Calopix TRIBVN, matériels serveurs / Datacenter)
- Cluster de calcul haute performance GPU (4 carte NVIDIA Tesla P100)

Galerie