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GAP2D-Grenoble Alpes Plateforme de Drug Disco
Responsable : Marie-Odile Fauvarque • Responsable Tech. : Dr. Caroline Barette, High-Throughput Screening (HTS) Dr. Emmanuelle Soleilhac, High-Content Screening (HCS) Dr. Yung-Sing Wong, Resp. scientifique ChemExpert (Chimie médicinale)
Adresse : Grenoble Alpes Plateforme de Drug Discovery
IRIG-BGE-GenChem/GAP2D/CMBA
CEA-Grenoble
17, avenue des Martyrs 38054 Grenoble Cedex
38054 Grenoble

complements

Certifications

Pas de certification ISO

Site web

http://www.cea.fr/drf/IRIG/Pages/Infrast...

Presentation de la plate-forme

La plateforme GAP2D développe des protocoles expérimentaux et des outils nécessaires pour le criblage et la sélection de molécules bioactives originales dans le cadre de projets de recherche scientifique ou pharmacologique.
Le déroulement classique d’un projet est le suivant:
• Analyse du projet et étude de faisabilité au niveau technique et financier
• Conseils et aide à la miniaturisation avec un accès aux locaux et équipements de la plateforme
• Programmation robotique, optimisation et validation du test
• Criblage de tout ou partie des collections de molécules chimiques, en microplaques de 96 ou 384 puits
• Analyses des données et sélection des touches (hit) grâce au logiciel open source TAMIS (logiciel développé en interne)
• Réalisation du Hit-picking et d’un criblage de validation
• Caractérisations des touches sur une série de tests orthogonaux, incluant des tests phénotypiques en microscopie automatisée (High Content Screening et Analysis) sur des modèles cellulaires 2D ou 3D
• Transfert des résultats (au minimum sous forme de données brutes associées aux structures des composés de la chimiothèque, identification statistique des hits via logiciel TAMIS, rapport de fin de criblage) simultanément au biologiste porteur du projet et aux chimistes détenteurs des chimiothèques (dans le seul cas du criblage de chimiothèques académiques sous MTA)
• Expertise en chimie médicinale sur les propriétés des touches sélectionnées incluant la Q-SAR et des analyses de docking in silico dans les cas où la structure de la cible est connue
• Recherche d’analogues structuraux commercialement disponibles
• Criblage d’analogues structuraux (SAR).

Moyens et equipements

CMBA :

- Plateforme robotique HTS (renouvelée mi-2013)
• Tecan’s EVO200 workstation, Têtes 8 canaux (it picking) et 96 canaux (adaptés aux plaques 96 et 384 puits)
• Incubateur de cellules LiCONiC’s “StoreX” STX44 (42 plaques)
• Laveur automatisé Tecan’s “HydroSpeed™”
• Lecteur de plaques Tecan’s “Infinite® M1000” (absorbance, fluorescence (dont FRET, HTRF, anisotropy) et luminescence (including BRET))
• Carousel Tecan
• Agitateur orbital
• Lecteur de code barre (traçabilité)

- Plateforme Imagerie HCS
• ArrayScanVTI (Fev 2012)
• IncuCyte Zoom (Nov 2017)
• Viaflo384 semi-automated liquid handling system (Avril 2019)

Plateforme ChemExpert :
- RMN 400 MHz à haut champ (2004)
- Balance haute précision
- Accès à équipements lourds via l' ICMG: FT-IR, RAMAN, X-ray diffraction.

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