Plateforme d'Analyse des Glycoconjugués
Responsable : Yann Guérardel • Responsable Tech. : Emmanuel Maes (100%)
Adresse : PAGés, Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle, Bat. C9, UMR CNRS 8576, Université Lille1
59655 Villeneuve d'Ascq
Presentation de la plate-forme
La plateforme PAGés a été créée en 2012. Elle est dédiée à l’analyse structurale des glycannes et glycoconjugués sous toutes leurs formes, i.e. glycolipides, glycoproteines, polysaccharides, oligosaccharides…. Elle est ouverte à tous les chercheurs du secteur académique et aux industries sous la forme de prestations ou de collaborations contractualisées. Elle a pour but principal de déterminer la séquence glycannique exhaustive des molécules (e.g. : polysaccharide de réserve ou de structure, oligosaccharide de constitution, modification post-traductionnelle …).
La plateforme a en charge la réalisation de toutes les prestations concernant l’analyse des glycoconjugués pour les laboratoires de la FR3688 CNRS et centralise les demandent issues du secteur industriel. Ces prestations sont de trois types : (1) fourniture de conseils stratégiques et opérationnels, (2) réalisation des analyses à partir d’échantillons préalablement purifiés et (3) mises au point et développements de technologies associées à l’analyse structurale des glycoconjugués.
PAGés se définit comme une plateforme de ‘savoir-faire’ et non comme une plateforme technologique car elle réalise ses prestations sur une multitude de technologies différentes auxquelles ses membres ont accès en fonction de la prestation à réaliser.
Moyens et equipements
La plateforme PAGés est une plateforme de savoir-faire dont la vocation est de partager ses connaissances pour l’avancement des glycosciences. En effet, l’étendue importante du panel technologique nécessaire à l’élucidation de la structure primaire des glycoconjugués est telle que la plateforme ne peut posséder en propre l’ensemble du matériel nécessaire. De fait, ses membres utilisent deux types d’équipements :
1- Des équipements appartenant en propre à la plateforme et/ou sous la gestion directe de ses membres. Ils incluent :
- Un spectromètre de masse : nano-LC AmazonSpeed-ETD-MS. Acheté en mars 2013. Co-financement-fonds propres (220000€).
- Une sonde RMN TBI H-X/BB-D 5 mm. Achetée en 2013. Co-financement BQR-Plateforme RMN-fonds propres (43580€)
- Deux chromatographes en phase gazeuse équipés de détecteurs de flamme (GC/FID)
- Un chromatographe en phase gazeuse couplé à un spectromètre de masse de type triple-quadrupôle (GC/MS-MS)
- Un onduleur pour la protection du matériel GC/MS.
- Du matériel de laboratoire : pipettes automatiques, centrifugeuses, étuve
2-Des équipements disponibles sur les plateaux techniques de l’UMR8576 CNRS et de la FRE3637 CNRS et sur les plateformes technologiques de l’Université Lille1. En particulier, les membres de PAGés utilisent le matériel à disposition au sein :
- Du plateau de chromatographie liquide (UMR 8576) : quatre HPLC équipées de détecteurs UV, de détecteurs de fluorescence et d’un réfractomètre différentiel ; un chromatographe d’échange d’anions à haut pH (HPAEC) équipé d’un détecteur ampérométrique ; un chromatographe AKTA-purifier
- De la plateforme de spectrométrie de masse de Lille1 (FR3688 CNRS) : Un MALDI-TOF, un MALDI-TOF/TOF
- De la plateforme RMN (Univ. Lille1) : spectromètres RMN 300MHz et 400MHz
- De la plateforme de RMN / TGIR RMN-THC (FRE3637) : spectromètres RMN 800MHz et 900MHz
Galerie
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