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CAPABIO-proteo
Responsable : Gérard Lambeau • Responsable Tech. : La plate-forme inclut 3 sites : IPMC, ISA, Rossi-TIRO. Responsables techniques: Anne-Sophie Dabert-Gay, 100%, IPMC Aurélie Séassau, 100%, ISA Jean-Marie Guigonis, 100%, Rossi-TIRO
Adresse : Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire (IPMC)
UMR7275 CNRS et Université de Nice Sophia Antipolis
660, route des Lucioles
Sophia Antipolis
06560 Valbonne

complements

Certifications

Pas de certification ISO

Site web

http://www.capabio.fr/

Presentation de la plate-forme

La plate-forme CAPABIO-proteo repose sur 3 sites (IPMC, ISA et Rossi-TIRO) localisés sur la technopôle de Sophia Antipolis et Nice avec un total de 4 ingénieurs dédiés (100% d'ETP pour chacun), une surface totale de 141 m2 de laboratoires dédiés à l'analyse protéomique, et plusieurs instruments d'analyse protéomique (cf ci-dessous).

Spécificité scientifique et descriptif succinct des 3 sites:
1. IPMC-CNRS Sophia-Antipolis : Responsables scientifiques et techniques : Anne-Sophie Dabert-Gay (IE), Delphine Debayle (IR), Gérard Lambeau (DR1), Pascal Barbry (DR1)
Analyse de mélanges complexes de protéines et peptides et protéomique par Nano-HPLC-MS/MS.
Surface disponible: 47 m².

ISA-INRA Sophia-Antipolis : Responsables scientifiques et techniques : Aurélie Séasseau (IE), Michel Ponchet (CR1).
Analyse protéomique par LC-MS/MS haute résolution et analyse d’interaction moléculaire par SPR (Résonance Plasmonique de Surface)
Surface disponible: 30 m².

Rossi-TIRO à Nice : Responsables scientifiques et techniques : Jean-Marie Guigonis (IR), Thierry Pourcher (DR2).
- Analyse protéomique par LC-MS/MS et Maldi-MS/MS haute résolution
- Analyse De Novo, identification de protéines inconnues et modifications post-traductionnelles.
- Imagerie 2D par DESI.
Surface disponible: 64 m².

De façon collective, nous proposons aux équipes de recherche:
- Un accueil personnalisé et une expertise dans l’accompagnement des projets scientifiques depuis la purification des protéines jusqu’à leur analyse par spectrométrie de masse.
- La caractérisation d’interactions par résonance plasmonique de surface (SPR).

CAPABIO-proteo propose à ce jour les services suivants :
1. Spectrométrie de masse (MS):
- Identification de protéines à partir d’échantillons issus d’électrophorèse ou de purification en phase liquide (par exemple empreinte peptidique et séquençage MS/MS)
- Caractérisation fine des protéines (par exemple dégradation de neuropeptides)
- Détermination de la séquence de nouvelles protéines (par exemple toxines)
- Identification de modifications post-traductionnelles (glycosylation, phosphorylation, s-nitrosylation, ubiquitination, …)
- Contrôle qualité de protéines recombinantes (masses exactes, qualité, pureté…)
- Imagerie MALDI-TOF/TOF : application à l’analyse différentielle de biomarqueurs protéiques sur biopsies.
- spectrométrie de masse quantitative

2. SPR :
- Caractérisation d’interactions moléculaires (protéine / protéine, ADN / protéine, protéines/drug discovery)
- Etude cinétique et d’affinité d’interaction
- criblage de banque de molécules

3. Expertises et conseils sur :
- Aspects méthodologiques : faisabilité, préparation des échantillons avant analyse, choix des systèmes d’analyse selon projet.
- Nouvelles techniques.
- Analyse et traitement des données.

Moyens et equipements

IPMC:
nano-HPLC Ultimate 3000, Dionex (2008)
MALDI-TOF/TOF 4800 plus, Applied Biosystems (2008)

ISA:
Nano-micro UHPLC U3000, Dionex (2010)
ESI-Q-TOF, Bruker Daltonique (2010)
Biacore 3000, GE Healthcare (2007)

Rossi-TIRO:
nano-capillary HPLC Ultimate 3000, Dionex (2010)
nano-capillary HPLC Surveyor, Thermo Fisher (2002)
LTQ/ORBITRAP Thermo Fisher (2006)
LCQ DECA XP PLUS Thermo Fisher (2001)
MALDI/TOF Applied De Pro (2001)
Sources : ESI (2001), APCI (2004), DESI 2D (2013), AP-maldi (2013)

Galerie

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