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Plateforme Protéome
Responsable : Marc BONNEU • Responsable Tech. : Stéphane CLAVEROL
Adresse : Plateforme Protéome
Centre Génomique Fonctionnelle Bordeaux
146 rue Léo Saignat
33076 BORDEAUX

complements

Certifications

  

Site web

http://www.cgfb.u-bordeaux2.fr/fr/proteo...

Presentation de la plate-forme

La Plateforme Protéome a pour vocation de satisfaire les besoins en protéomique liés aux activités de recherche des laboratoires académiques et industriels. Elle correspond à une Plateforme ouverte à l'ensemble de la communauté par la mise à disposition de matériels, de services et d’expertises.
L’objectif de la Plateforme Protéome est de développer et de proposer les technologies actuelles dans les domaines de la protéomique quantitative (non ciblée, ciblée et absolue), la caractérisation des protéines (masse moléculaire exacte, modifications post traductionnelle) et l’imagerie par spectrométrie de masse.
Les prestations actuellement offertes sont :
Extraction des protéines
Séparation des protéines : SDS-PAGE, BN-PAGE, 16-BAC-PAGE, IPG/SDS-PAGE, BN/SDS-PAGE, 16-BAC/SDS-PAGE
Isoélectrofocalisation en veine liquide (système Rotofor® et système Off-Gel®)
Détection des protéines séparées par électrophorèse sur gel (Bleu de Coomassie colloïdal ou non colloïdal, Nitrate d’argent, SyproRuby® ou Ruthenium, ProQ Diamond®, ProQ Emerald®
Numérisation des gels par scanner à transmission et à fluorescence
Analyse par spectrométrie de masse
-Digestion des protéines
-Traitement des échantillons par microchromatographie C18 ou C4
-Marquage iTRAQ
-Identification de protéines
-Analyse Label-Free
-Recherche de modifications post-traductionnelles
-Enrichissement des phosphopeptides ou des peptides ubiquitinylés
-Recherche des sites de glycosylation
-Séquençage de novo
-Mesure de masse moléculaire de protéines
-Imagerie MALDI

Moyens et equipements

Purification des protéines
- FPLC AKTA Explorer GE Healthcare
- FPLC Ettan LC GE Healthcare
- PF2D Beckman

Electrophorèse :
- Electrophorèse 2D GE Healthcare et BioRad
- Pharos BioRad
- GS 800 BioRad
- Experion BioRad
- Spot Exciser BioRad
- OffGel Agilent

Spectrométrie de masse :
- 3 nanoHPLC Dionex
- Robot Probot Dionex
- ESI-Q-ToF Micro Waters (2005)
- MALDI Q-ToF Premier Waters (2005)
- MALDI-TOF-TOF Ultraflex III Bruker (2009)
- Détecteur haute masse CovalX (2009)
- LTQ-Orbitrap XL ETD (2009)
- Q-Exactive (2013)

Galerie

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