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IMAG'IC
Responsable : Florence Niedergang • Responsable Tech. : Pierre Bourdoncle
Adresse : Institut Cochin
22, rue Méchain
75014 Paris

Presentation de la plate-forme

- Assistance sur tous types de microscopes ainsi que sur le traitement d'images

- Formation pour l'autonomie sur tous types de microscopes ainsi que sur le traitement d'images.
Formations individuelles ou par groupe pour les logiciels ImageJ et Imaris

-Mise à disposition d’un service de sauvegarde et d’archivage d’images : Cochin Image Database
https://imagerie.cochin.inserm.fr/

- Restauration d'images par déconvolution 3D en ligne (serveur) sur l'ensemble des microscopes. PSFs théoriques ou expérimentales

- Traitement et analyse d'images 3D+t : ImageJ, Imaris, MetaMorph, Matlab, Huygens
Création de macros à la demande, traitement par lot.

- Applications : TIRF, FRET, FRAP, Calcium (Fura-2 ou Fluo), Lame Virtuelle, Photo-activation PA-FP, photo-conversion PS-FP, photo-dommage, FISH, PALM, dSTORM.
Suivi cellulaire 24 - 48h

- Interactions hôte-pathogènes : microscopie à « pinning disk » dans laboratoire de confinement L3 avec accueil des équipes extérieures.

-Études sur tissus humain : microscopie à « spinning disk » dans laboratoire de confinement L2 avec accueil des équipes extérieures.

-Microscopie super-résolution : accompagnement de la préparation d’échantillon à la reconstruction et à la quantification des images super-résolues. dSTORM 3D multi-couleurs, PALM, sptPALM.

-ImageStreamX : imageur en flux pour cellules en suspension

- Microscopie in situ : multi-photons avec canner résonant 20 images/s, détection spectrale, système d'anesthésie (murin), milieu perfusé O2 pour coupes épaisses, SHG, lame virtuelle

- Plate-Forme certifiée ISO 9001 version 2008 délivré par l'ARFNOR en octobre 2012

Moyens et equipements

- Microscope électronique à transmission Jeol 1011 2007

- Microscopie super résolution
GSD 3D PALM dSTORM multi-couleurs 2015

- Imagerie en flux
ImageStreamX MKII 2013

- 3 Microscope confocaux
Microscope spinning disk in vivo lame virtuelle 2010
Microscope spinning disk in vivo lame virtuelle confinement L3 2011
Microscope spinning disk in vivo lame virtuelle prochainement en L2 2016

-Microscopie in situ
Microscope multi-photons Leica SP5 2006
plaque chauffante et système d'anesthésie Isoflurane (murin)
milieu perfusé O2 pour coupes épaisses
laser IR femto seconde + OPO : excitation multi-photon enter 690 et 1600nm
SHG (collagène I et IV, fibrogénèse, µtubules, sarcomères, os)

-Microscopie plein champ
Macroscopie fluorescence et colorants Nikon AZ100 motorisé 2010
Microscope TIRF FRAP FRET, TILL Photonics iMIC système double caméra EMCCD pour FRET 2009
3 Microscopes à champs larges épi-illumination pour échantillons vivants, lame virtuelle, déconvolution 3D 2003-2011
3 Microscopes à champs larges épi-illumination pour échantillons fixés, déconvolution 3D 2007-2013
loupe binoculaire pour fluorescence et colorants

- Analyses et traitements d'images
2 stations d'analyse et de traitement d'images (ImageJ MetaMorph Imaris Matlab Huygens)
1 station dédiée à la restauration d'images par déconvolution 3D (Huygens)

Galerie