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CRB-Anim

Collecte, préservation, documentation et distribution de ressources biologiques pour la caractérisation de la diversité génétique des animaux domestiques et de modèles biomédicaux spontanés. 

Site du réseau de CRB

CRB-Anim

Collecte, préservation, documentation et distribution de ressources biologiques pour la caractérisation de la diversité génétique des animaux domestiques et de modèles biomédicaux spontanés. 

Site du réseau de CRB

CRB-Anim

Le réseau CRB-Anim rassemble 6 CRB certifiés ISO 9001, qui gèrent des ressources biologiques pour la reproduction et la génomique provenant de 25 espèces animales domestiques, de ferme et de compagnie. Ses objectifs sont la connaissance de la diversité génétique et la caractérisation de modèles biologiques et médicaux. 

Le couplage des collections reproductives et génomiques s’inscrit dans les missions du réseau, afin de permettre la caractérisation génomique des animaux à préserver ou à utiliser pour réintroduire de la diversité dans les populations actuelles. Le CRB-Anim s’engage à faciliter le partage et la réutilisation des échantillons, contribuant ainsi à réduire le nombre d’animaux en expérimentation en lien avec les 3R. 

Les objectifs technologiques du CRB-Anim visent à garantir la qualité des échantillons stockés et distribués. Pour cela, le réseau dispose des compétences nécessaires en biologie cellulaire, biologie moléculaire, cryobiologie et biotechnologies de la reproduction. Ses perspectives sont de développer de nouveaux indicateurs de fertilité et de nouvelles méthodes de biologie cellulaire, incluant les cellules souches et les modèles cellulaires, dans un cadre national et européen.

Expertises et services

  • Collecte d’échantillons biologiques provenant d’animaux domestiques, définition de protocoles de collecte et mise en collection d’échantillons,
  • Définition et mise en œuvre de contrôles qualité des gamètes, cellules et acides nucléiques,
  • Gestion des données associées aux échantillons dans un portail commun aux CRB du réseau,
  • Stockage des échantillons à long terme sur une large gamme de température, allant de la température ambiante pour les blocs histologiques, à -196°C pour les paillettes de semences,
  • Caractérisation, extraction d’acides nucléiques et préparation de librairies de séquençage, notamment pour le microbiote, l’histologie et la cytométrie,
  • Distribution de matériel biologique pour l’élevage et la recherche,
  • Dispense de formations pratiques sur les biotechnologies de la reproduction et de formations académiques sur les objectifs et activités des biobanques animales pour les masters spécialisés en biobanking et dans les filières animales.

Composition des collections

Ressources biologiques animales :

  • 730 000 échantillons de semences animales, embryons, larves, sang, lait, salive, urine et autres fluides biologiques, fèces, tissus gonadiques, tissus somatiques, blocs histologiques, cultures cellulaires et acides nucléiques,
  • Échantillons provenant de 100 000 individus, représentant 650 races et 25 espèces d’animaux domestiques, de ferme et de compagnie.

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Comment accéder au réseau ?

Le réseau CRB-Anim publie son catalogue de ressources sur un portail unique. Des métadonnées minimales sont en accès libre, mais la création d’un compte utilisateur est nécessaire pour accéder à l’ensemble des métadonnées, établir une demande d’entrée ou de sortie d’échantillons. Toutes les demandes sont suivies sur le portail, qui permet la fourniture de devis, la signature et la conservation des accords de transfert de matériels. Les utilisateurs peuvent également bénéficier de l’interface mail dédiée pour contacter les responsables des CRB concernés par leurs projets, ou les groupes d’experts en cas de questions scientifiques. Les demandes de sortie d’échantillons sont systématiquement suivies d’une enquête de satisfaction. 

Exemple d'utilisation

Mise au point et validation de nouvelles puces de génotypage

Une puce SNP multi-espèces a été développée dans le cadre du projet européen IMAGE, pour comparer la diversité des collections des biobanques pour les six espèces les plus représentées : bovins, ovins, caprins, équins, porcins, et poulets. 

Pour cela, deux CRB du réseau CRB-Anim ont fourni l’ADN de 228 animaux correspondant à 11 lignées de poulets, 11 races locales et une nationale de chevaux, 5 races porcines locales, 6 races ovines, 3 races caprines et 3 lignées porcines sino-européennes. L’ADN de ces animaux a été extrait à partir de divers tissus, notamment de biopsies cutanées, de sperme et de sang. La puce IMAGE001 a été conçue et validée avec un nombre moyen de 10 000 marqueurs par espèce. Publiquement accessible auprès de Thermo Fisher Scientific, elle a été utilisée pour du contrôle de filiation, notamment chez le poulet. En 2022, 384 animaux de la Cryobanque nationale (CBN), comprenant 141 moutons, 142 chevaux et 99 porcs, ont également été génotypés avec cette puce. Les résultats ont été fournis aux instituts techniques, éleveurs et chercheurs intéressés. 

En ce qui concerne le chien, un ensemble de 250 échantillons d’ADN représentant la plupart des races française a été fourni par le CRB Cani-DNA à un consortium international pour développer une puce de 200 000 SNP.

Contact

CRB-Anim
UMR 1313 GABI
INRAE, Domaine de Vilvert
78352 Jouy-en-Josas
Région : Île-de-France+33 (0)1 34 65 21 78
contact-crb-anim@inrae.fr
Site du réseau de CRB

CRB-Anim

 

THÉMATIQUES : Animal

COLLECTIONS : Tissus, fluides biologiques, gamètes, embryons, larves, cellules et acides nucléiques d’animaux domestiques, mammifères, oiseaux, poissons, coquillages et insectes

MEMBRES DU RÉSEAU : aBRIDGe-Biobanque, Cani-DNA, CARARE, CryAnim, Cryobanque nationale (CBN)

COORDINATEURS : Michèle Tixier-Boichard, Delphine Muller

RESPONSABLES QUALITÉ : Déborah Jardet

CENTRES GESTIONNAIRES : INRAE

LABELLISATION IBiSA : 2015

MOTS CLÉS : Mammifère, Oiseau, Poisson, Coquillage, Insecte, Cryoconservation, Biologie de la reproduction, Génétique, Biodiversité, Race animale, Anomalie génétique, Consanguinité, Sélection animale, Génomique, Microbiote, Démarche 3R

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