Karubiotec
Gestion de collections d’échantillons biologiques humains pour les projets de recherche et de santé publique en population antillaise.
Karubiotec
Gestion de collections d’échantillons biologiques humains pour les projets de recherche et de santé publique en population antillaise.
Karubiotec
Karubiotec est le CRB de santé humaine du CHU de la Guadeloupe. Il gère des collections d’échantillons biologiques humains pour les projets de recherche portant sur des thématiques de santé publique en population antillaise, en particulier sur le cancer, les maladies infectieuses et émergentes, les pesticides et les maladies environnementales. D’autres thématiques y sont traitées, notamment les maladies cardiovasculaires, métaboliques et neurodégénératives, ou encore les maladies immuno-hématologiques spécifiques des populations antillaises.
La délégation à la recherche clinique et à l’innovation (DRCI) du CHU de la Guadeloupe centralise l’ensemble des projets de recherche dont le CHU assure la promotion, ainsi que les projets de promotion externe. L’étroite collaboration entre Karubiotec, la DRCI, le centre d’investigation clinique (CIC) Antilles Guyane et les organismes de recherche partenaires confère au CRB un regard privilégié sur la mise en place des études sélectionnées. Karubiotec dispose également de son propre plateau technique dédié à la biologie moléculaire, lui permettant de développer des techniques et des outils utiles au soutien de la recherche locale.
Expertises et services
- Préparation et conservation d’échantillons biologiques humains,
- Extraction et dosage d’ADN et ARN humain, bactérien et viral,
- Dosage de protéines totales,
- Anonymisation et pseudo-anonymisation des échantillons (étiquetage),
- Qualification de banques d’ADN et ARN sur TapeStation,
- Test de viabilité par acridine orange ou propidium iodide et évaluation en bleu de trypan,
- Conservation des échantillons par congélation à -20°C, -80°C ou longue durée en azote liquide,
- Réalisation d’analyses de biologie moléculaire : génotypage, PCR, séquençage, Southern blot (sonde biotinylée) et électrophorèse,
- Réalisation d’analyses de microbiologie et virologie : test de Nugent et sérologie (IgM, IgG),
- Mise à disposition des collections conservées.
Composition des collections
Echantillons biologiques humains pour la recherche :
- Plus de 73 000 échantillons de sérum, plasma, pus d’abcès hépatique, urine, placenta, buffy coat, PBMC, ADN et ARN humain et bactérien, tissus, culots et écouvillons nasopharyngés répartis dans 38 biocollections,
- Pathologies représentées : cancers, maladies infectieuses et émergentes, maladies cardiométaboliques, neurodégénératives et immunohématologiques (dont la drépanocytose), troubles de la procréation, pathologies environnementales (pesticides, chlordécone)...
Comment accéder au CRB ?
Pour toute demande, vous pouvez contacter Karubiotec par mail à l’adresse crb@chu-guadeloupe.fr ou à l’aide du formulaire de contact mis à disposition sur le site web du CRB. Un formulaire de demande vous sera envoyé dans le but de clarifier votre projet, de vérifier sa conformité avec la collecte déclarée et le consentement éclairé des patients. Dans le cas où le projet est accepté, vous recevrez un document reprenant les mesures de propriété intellectuelle, les conditions financières, les responsabilités des différents partis, les conditions d'utilisation des données et de publication des résultats. Les délais de mise en œuvre des travaux dépendent de la complexité de la demande et s’étendent généralement de 1 à 5 jours.
Exemple d'utilisation
Décryptage de l’infection par le virus Zika
Karubiotec a été le centre gestionnaire de la cohorte Zika-DFA-FE, qui a permis de décrire l’infection par le virus Zika chez les femmes enceintes aux Antilles et en Guyane. Une collaboration a eu lieu avec le Centre nationale de référence (CNR) de Marseille afin de caractériser la réponse immunitaire associée à l’infection in utero. Le contact avec le virus a été vérifié par analyse du sérum issu de sang de cordon et de sang maternel. Karubiotec a réalisé l’ensemble des sérologies IgG et IgM des patients.
Pour en savoir plus : Grant R. et al. (2022). Consequences of in utero Zika virus exposure and adverse pregnancy and early childhood outcomes: A prospective cohort study. Viruses, 14(12):2755.
Contact
Karubiotec
CHU de la Guadeloupe
Route de Chauvel, site de Ricou
Bâtiment E, niveau -1
97159 Pointe-à-Pitre
Région : DOM - Guadeloupe+590 (0)5 90 93 46 80
crb@chu-guadeloupe.fr
Site du CRB
THÉMATIQUES : Environnement, Santé
COLLECTIONS : Échantillons biologiques humains pour la recherche sur le cancer, les maladies cardiométaboliques, neurodégénératives, immunohématologiques, infectieuses et émergentes, les troubles de la procréation, les pesticides et les pathologies environnementales
COORDINATEURS : Stanie Gaëte
RESPONSABLES COLLECTIONS : Jacqueline Deloumeaux
RESPONSABLES QUALITÉ : Stanie Gaëte
TUTELLES : CHU de la Guadeloupe
LABELLISATION IBiSA : 2017
MOTS CLÉS : Cancer, HPV, Papillomavirus, HTLV, Maladies infectieuses, Arbovirus, Covid-19, Virus Zika, Chikungunya, Dengue, Maladies cardiaques, Hypertension artérielle, HTA, Diabète, Amylose cardiaque, Chlordécone, Pesticides, Maladies hématologiques, Drépanocytose, Microbiote, Génotypage, ELISA, TapeStation, Séquenceur, Thermocycleur, CellDrop, Microscope
Fiche mise à jour en 2023