CRB Plantes tropicales (CRB-PT)

Le CRB-PT a pour vocation de conserver et de valoriser des collections de ressources génétiques d’espèces tropicales à multiplication végétative, au champ, avec dans certains cas des doubles de sauvegarde in vitro. Ces collections, d’importance mondiale, sont localisées en Guadeloupe, sur différentes stations du Cirad et d’INRAE, à l’exception de la collection d’ananas en Martinique.

Les espèces à multiplication végétatives conservées par le CRB sont soumises à une forte pression sanitaire, notamment des virus, ce qui a conduit au développement de compétences en virologie, en particulier concernant la diversité virale de l’igname et de l’ananas. 

Les accessions disposent toutes de données passeport et de données de caractérisation morphologiques. Au-delà de la collecte, conservation et diffusion de ressources biologiques, le CRB-PT conduit des activités de recherche en phénotypage et génotypage de ses collections. 

Expertises et services

• Conservation de ressources génétiques de plantes tropicales,
• Diffusion et mise à disposition d'accessions et des données associées,
• Production de données de caractérisation morphologique, phénotypique et génétique,
• Production de matériel biologique assaini, 
• Identification variétale et évaluation du statut viral, 
• Appui à l’enseignement et à la formation professionnelle.

Composition des collections

Collection de bananier :

• 407 accessions de bananier conservées au champ,
• Principales espèces : banane dessert, plantain, banane à cuire, bananiers floraux et espèces sauvages apparentées dont Musa acuminata et M. balbisiana,
• 3^e collection mondiale au champ représentative de la diversité des bananiers.

Collection d’igname :

• 416 accessions d’igname conservées in vitro avec régénération au champ,
• Principales espèces : Dioscorea alata, D. trifida, D. cayenensis, D.rotundata, D. bulbifera, D. esculenta et variétés améliorées,
• Origine des accessions : Antilles françaises, Caraïbes, Nouvelle-Calédonie, Guyane, Afrique et Guadeloupe pour les variétés améliorées,
• Collection historique du Cirad. 

Collection d’ananas :

• 347 accessions d’ananas conservées au champ, en serre et in vitro,
• Principales espèces : Ananas comosus, A. ananassoïdes et espèces apparentées,
• Origine des accessions : Brésil, Venezuela, Guyane, Paraguay, Pérou, Antilles, USA, Côte d’Ivoire, Guinée, Philippines, Thaïlande…
• Collection représentative de la diversité de l’ananas dans sa zone d’origine, le bassin amazonien.

Collection de canne à sucre :

• 335 accessions de canne à sucre conservées au champ,
• Principales espèces : Saccharum officinarum et espèces sauvages apparentées dont S.robustum et S.spontaneum,
• Origine des accessions : Brésil, Bélize, Barbade, Floride, Jamaïque, Fidji, Nouvelle Guinée, Soudan, Porto Rico, La Réunion, Taïwan...

Collection de manguier :

• 120 accessions de manguier conservées au champ,
• Origine des accessions : Afrique de l’ouest, Caraïbes, Asie, Inde, Guadeloupe, Martinique, 
• Collection historique du Cirad.

Comment accéder au CRB ?

L’accès aux ressources génétiques du CRB-PT se fait par différents moyens. Les utilisateurs locaux peuvent se présenter directement sur les sites Cirad et INRAE de Roujol et Duclos à Petit-Bourg. Une adresse mail générique est disponible pour toute demande de renseignements et de matériel végétal. Le portail Florilège présente les accessions et permet de passer commande en ligne.

Exemple de projet

Contribution des collections de plantes à la connaissance de la diversité biologique virale

L'objectif général du projet SafePGR était d'améliorer la connaissance de la diversité des virus infectant les espèces conservées par des CRB partenaires, afin de développer ou d'optimiser les techniques de diagnostic. A terme, il visait à limiter le risque de propagation des maladies virales par l'échange de matériel génétique de plantes tropicales.

Pour atteindre cet objectif, les CRB partenaires de la Guadeloupe, de Madère, des Açores et de La Réunion ont combiné des approches de biologie moléculaire classique et de séquençage de nouvelle génération (NGS), aboutissant à une découverte sans précédent de virus dans les cultures ciblées : banane et plantain, canne à sucre, igname, patate douce, ail et vanille.

Au total, 21 nouvelles espèces de virus ont été mises au jour. Leur diversité moléculaire a été explorée, conduisant à la mise en place de méthodes de diagnostic pour ces nouveaux agents, à l’amélioration des méthodes déjà utilisées et à l'optimisation du processus d’assainissement, notamment sur igname. Le projet a également renforcé la connaissance du statut viral des collections du CRB et la possibilité de prévenir la propagation ou l'émergence de maladies.

Pour en savoir plus : Umber et al. (2020). Molecular viral diagnosis and sanitation of yam genetic resources: implication for safe yam germplasm exchange. Viruses, 12(10):1101.

Contact

CRB-PT
Cirad, Station de Roujol
97170 Petit-Bourg
Région : DOM - Guadeloupe+590 (0)5 90 38 61 67
crb.plantes-tropicales@cirad.fr
Site du CRB

 

THÉMATIQUES : Plantes

COLLECTIONS : Ressources génétiques de bananier, igname, ananas, manguier et canne à sucre

COORDINATEURS : Youri Uneau

RESPONSABLES COLLECTIONS : Joël Mahadéo (bananier), Nilda Paulo de la Réberdiere (ananas), Delisia Casi (igname), Steeve Joseph (canne à sucre), Youri Uneau (manguier)

RESPONSABLES QUALITÉ : Nilda Paulo de la Réberdiere

TUTELLES : Cirad, INRAE

INFRASTRUCTURES NATIONALES : RARe

LABELLISATION IBiSA : 2009

MOTS CLÉS : Antilles, Guadeloupe, Ressources génétiques, Plantes tropicales, Bananier, Igname, Ananas, Canne à sucre, Manguier, In vivo, In vitro, Caractérisation, Assainissement, Virologie, Phénotypage, Génotypage

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