Tumorothèque régionale de Franche-Comté (TRFC)

Constitution, conservation et mise à disposition de collections d’échantillons tumoraux humains pour la recherche et l’innovation en cancérologie.

Site du CRB

Tumorothèque régionale de Franche-Comté (TRFC)

Constitution, conservation et mise à disposition de collections d’échantillons tumoraux humains pour la recherche et l’innovation en cancérologie.

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Tumorothèque régionale de Franche-Comté (TRFC)

La TRFC a pour objectif de constituer et de valoriser des collections d’échantillons tumoraux humains afin de soutenir la recherche fondamentale, translationnelle et clinique en cancérologie. Ses missions incluent la collecte standardisée de fragments tumoraux et de tissus normaux appariés, leur traitement et leur conservation, ainsi que la gestion des données associées, garantissant qualité et traçabilité.

La TRFC apporte son expertise dans le contrôle morphologique des échantillons, la préparation de blocs et de lames, et l’optimisation des protocoles de conservation pour différents types de tissus. Adossée au service d’anatomie-pathologique du CHU de Besançon, elle est capable de mettre en œuvre des analyses avancées, telles que l’immunohistochimie, l’immunofluorescence, la numérisation et la quantification de biomarqueurs tissulaires. Ses spécificités résident dans la diversité et la qualité des prélèvements, la possibilité de centraliser des échantillons pour des études multicentriques et la collaboration étroite avec les équipes de recherche fondamentale et clinique. La TRFC contribue ainsi à la valorisation scientifique des ressources biologiques et à l’accélération de l’innovation en cancérologie.

Expertises et services

Collecte et centralisation des échantillons tumoraux et des tissus normaux provenant des services cliniques, des structures d’appui à la recherche du CHU de Besançon et de structures coopératives de recherche clinique,
Préparation d’échantillons de tissus frais et mise à disposition immédiate,
Annotation, enregistrement et conservation d’échantillons de manière contrôlée et sécurisée à température ambiante, -20 °C, -80 °C, ou sous azote liquide,
Préparation de tissus fixés et inclus en paraffine (FFPE) ou congelés pour des analyses qualitatives et quantitatives,
Réalisation d’analyses tissulaires avancées : contrôle morphologique, enrichissement en cellules tumorales, immunohistochimie (IHC > 250 marqueurs), immunofluorescence, hybridation in situ en fluorescence (FISH), extraction, qualification et dosage des acides nucléiques, quantification des signaux et biomarqueurs tissulaires sur lames numérisées,
Gestion des données associées aux échantillons garantissant fiabilité et traçabilité,
Mise à disposition d'échantillons et des données associées pour des études multicentriques,
Réalisation d’analyses statistiques et extraction de données,
Accompagnement de projets de recherche publique et clinique.

Composition des collections

Tissus humains sains, tumoraux et pathologiques :

Plus de 50 000 échantillons de tissus sains, tumoraux et pathologiques,
Plus de 20 collections tumorales réparties par thématiques : cancers gynécologiques et ORL induits par le papillomavirus, cancers du système nerveux central, cancers du pancréas, cancers de la peau, cancers digestifs, sarcomes, tumeurs pédiatriques et lymphomes,
4 collections non tumorales développées selon les besoins et spécialités locales : spondylarthrite inflammatoire, maladies inflammatoires chroniques de l'Intestin (MICI), échinococcoses, fibrose hépatique et cirrhose.

<hr>Boite de cryotubes contenant des fragments de tissus sains et tumoraux conservés sous azote liquide.

<hr>Fragment de tissu tumoral conditionné dans un milieu de conservation avant son transfert pour mise en culture cellulaire.

<hr>Séchage de lames HES avant numérisation.

<hr>Section d’un bloc FFPE au microtome.

<hr>Conditionnement d’un échantillon pour son transfert routier.

<hr>Échantillonnage et préparation de cassettes avant imprégnation et inclusion FFPE. Un niveau de vigilance important est demandé à cette étape pour l’identification précise des zones échantillonnées.

Comment accéder au CRB ?

Vous pouvez contacter la TRFC par mail à l’adresse tumorotheque@chu-besancon.fr. Différents formulaires peuvent être téléchargés pour établir une demande d’échantillons ou mettre en place une collection biologique. Après une étude de faisabilité, votre demande sera soumise au comité scientifique de la TRFC. Un contrat de partenariat sera rédigé si le projet est accepté.

Exemple de projet

Le cytomégalovirus est capable de transformer des cellules ovariennes normales en cellules cancéreuses géantes

Dans le cadre d’une étude menée sur le cytomégalovirus, la TRFC a joué un rôle clé en mettant à disposition des tissus ovariens conservés depuis plus de dix ans dans de l’azote liquide. Ces échantillons ont permis de confirmer la présence persistante du cytomégalovirus après toutes ces années, en garantissant un contrôle morphologique qualitatif. Grâce à son expertise en anatomopathologie, la TRFC a également fourni un comptage précis des cellules géantes polyploïdes (PGCC) et des ADN de haute qualité présents dans les échantillons afin de servir les analyses moléculaires à mener. La TRFC a ainsi permis aux chercheurs d’explorer les effets du virus sur les cellules ovariennes et d’avancer dans la compréhension des mécanismes de transformation cellulaire.

Pour en savoir plus : El Baba R. et al. (2023). Polyploidy, EZH2 upregulation, and transformation in cytomegalovirus-infected human ovarian epithelial cells. Oncogene, 42(41):3024-3061.

Contact

Tumorothèque régionale de Franche-Comté (TRFC)
Hôpital Jean Minjoz
3 boulevard Fleming
25030 Besançon
Région : Bourgogne-Franche-Comté+33 (0)3 81 66 89 66
tumorotheque@chu-besancon.fr
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