Versailles Arabidopsis stock center (VASC)

Le CRB VASC a créé d’importantes collections de mutants d’Arabidopsis thaliana, qui permettent d’explorer la fonction des gènes. Il propose également de nombreux variants naturels collectés dans le monde entier, ainsi que des plantes issues de croisements entre ces variants, permettant d’analyser l’impact de la diversité naturelle, notamment sur des caractères complexes de la vie des plantes tels que la croissance, le développement, la reproduction ou la tolérance aux stress. Du fait de l’abondance des ressources génétiques disponibles, Arabidopsis thaliana constitue un excellent modèle pour explorer ces mécanismes.

Expertises et services

• Production de ressources génétiques d’Arabidopsis thaliana,
• Acquisition et introduction de nouvelles ressources,
• Multiplication et conservation des ressources,
• Distribution des ressources à la communauté scientifique internationale.

Composition des collections

Ressources génétiques d’Arabidopsis thaliana :

• 54 915 lignées d’insertion de T-DNA correspondant à 46 236 flanking sequence tags (FST),
• 777 accessions naturelles (écotypes),
• 262 populations F2 de cartographie,
• 16 populations de lignées recombinantes (RIL) représentant 5 524 lots de graines,
• 3 sets de lignées quasi-isogéniques HIF (heterogeneous inbred family) représentant 265 lots de graines,
• 524 epiRIL issues de lignées recombinantes épigénétiques,
• 56 cytolignées,
• 879 lignées issues d’une collection de mutants EMS homozygotes.

Comment accéder au CRB ?

Les collections du CRB VASC sont détaillées sur son site internet. Les commandes doivent être passées en ligne après inscription. Les ressources sont généralement expédiées sous quelques jours, comprenant environ 100 graines par lignée et 500 graines pour les F2. Les graines sont gratuites si elles sont utilisées à des fins uniquement éducatives.

Exemple d'utilisation

Recherche de mutants de méiose chez Arabidopsis thaliana

Les cribles génétiques ont permis de décrypter de nombreux processus biologiques essentiels, comme la méiose. Chez Arabidopsis thaliana, ils ont vraisemblablement permis d’identifier presque tous les gènes méiotiques qui, lorsqu'ils sont mutés, entraînent une diminution importante de la fertilité. Cependant, les études de génétique inverse font ressortir un nombre croissant de gènes méiotiques sans phénotype marqué une fois mutés, suggérant que de nombreux gènes impliqués dans la méiose restent encore à découvrir.

En utilisant 897 lignées mutantes homozygotes d'Arabidopsis thaliana produites avec le CRB VASC, des chercheurs de l’Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB) ont identifié 43 lignées avec des défauts méiotiques. Parmi celles-ci, 21 lignées portaient une mutation causale candidate sur un gène dont le rôle dans la méiose a déjà été démontré. 6 de ces gènes ont ainsi été identifiés pour la première fois dans un crible chez Arabidopsis. Ces résultats illustrent tout le potentiel de la population de mutants homozygotes étudiée.

Pour en savoir plus : Capilla-Perez L. et al. (2018). The HEM lines: A new library of homozygous Arabidopsis thaliana EMS mutants and its potential to detect meiotic phenotypes. Frontiers in Plant Science, 9:1339

Contact

Versailles Arabidopsis stock center (VASC)
Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB)
INRAE, RD10
78000 Versailles
Région : Île-de-France+33 (0)1 30 83 33 69
ijpb-publiclines@inrae.fr
Site du CRB

THÉMATIQUES : Plantes

COLLECTIONS : Mutants T-DNA et EMS, variants naturels, RIL, epiRIL, HIF et cytolignées d’Arabidopsis thaliana

COORDINATEURS : Christine Camilleri

RESPONSABLES COLLECTIONS : Anthony Ricou

RESPONSABLES QUALITÉ : Christine Horlow

TUTELLES : INRAE

INFRASTRUCTURES NATIONALES : RARe

LABELLISATION IBiSA : 2023

MOTS CLÉS : Plante, Arabidopsis thaliana, Génétique, Conservatoire, Diversité naturelle, Mutants, T-DNA, Population de cartographie, F2, RIL, HIF, Cytolignée

Fiche mise à jour en 2024

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