Caribbean animal genetic resources (CARARE)

Le CRB CARARE assure la cryoconservation de semences pour l’insémination artificielle et d’embryons des races bovines, caprines et porcines Créole. Ces collections présentent un intérêt patrimonial pour la préservation des ressources génétiques animales locales des Caraïbes. Le CRB gère également des collections de sang, d’ADN et de différents tissus biologiques issus de programmes de recherche portant sur les mécanismes physiologiques d’adaptation au milieu tropical ou de réponse immunitaire aux maladies, et sur l’architecture génétique de ces caractères.

Les ressources biologiques du CRB sont mobilisées dans différents projets scientifiques menés par les chercheurs de l'unité de recherche Agroécologie, génétique et systèmes d'élevage tropicaux (ASSET) responsable des collections. Ces projets sont conduits en partenariat avec des équipes nationales et internationales. Les activités de collecte, conservation et diffusion des collections sont encadrées par des procédures d’assurance-qualité. Par ailleurs, les collections du CRB CARARE sont complémentaires de la conservation in situ de ressources génétiques animales dans les troupeaux dits « pépinières » de la Plateforme tropicale élevage pour l'agroécologie (PTEA), et en ferme par les éleveurs membres des organismes de sélection.

Expertises et services

• Conservation de semences et d’embryons d'espèces bovines, caprines et porcines Créole,
• Gestion des collections de matériel biologique conservées à -20°C, -80°C et -196°C,
• Mise à disposition d’échantillons pour des recherches en physiologie et génétique animale,
• Mise à disposition de semences et d’embryons pour la gestion génétique des races locales.

Composition des collections

Echantillons génétiques et reproductifs des races animales Créole :

• Sperme congelé de taureau, bouc et verrat Créole conservé à -196°C,
• Embryons de caprin et bovin Créole conservés à -196°C,
• Sang et fragments de cartilage conservés à -20°C pour des analyses génomiques,
• Fèces conservées à -20°C pour des analyses métagénomiques,
• Tissus divers conservés à -80°C pour des analyses transcriptomiques,
• Possibilité de rattachement des échantillons à des données phénotypiques issues de programmes de recherche avec caractères d’adaptation ou de production en milieu tropical.

Comment accéder au CRB ?

Pour déposer une collection de ressources biologiques au CRB CARARE, vous pouvez contacter le référent scientifique, Michel Naves, qui vous enverra un formulaire à remplir afin de préciser l’objectif de la mise en collection, la nature des échantillons, leurs conditions de prélèvement et de conservation. Votre demande sera évaluée par le comité de gestion des collections du CRB, en regard de différents critères comme l’adéquation du projet aux objectifs du CRB, les exigences techniques et le respect de la réglementation.

Les conditions d’utilisation des échantillons sont définies par les responsables des collections. Toute cession d’échantillons doit faire l’objet d’une demande de mise à disposition auprès du référent scientifique du CRB, qui la soumettra au responsable de la collection concernée. La demande ne sera acceptée que si le responsable de la collection l'autorise. Elle devra également être validée par le comité de gestion des collections du CRB.

L’acceptation des demandes d’intégration ou de mise à disposition de matériel donnent lieu à la signature d’une convention, avant transmission des échantillons. L'intégralité des démarches peut aussi être réalisée sur le portail du réseau CRB-Anim.

Exemple de projet

Caractérisation génétique du bovin Créole de Guadeloupe 

Grâce au stockage d'échantillons de sang et de sperme sur plusieurs générations, les collections du CRB CARARE ont permis de repérer des reproducteurs représentatifs de la population de bovins Créole de Guadeloupe. Les échantillons issus de ces animaux ont été analysés par séquençage complet du génome. Les données générées ont permis d'identifier des régions du génome soumises à sélection au sein de cette population de bovins, ainsi que des variants structuraux spécifiques à la race Créole de Guadeloupe. Il a ainsi été démontré que la thermotolérance, l'endurance physique et la résistance à des agents pathogènes locaux sont des facteurs importants de l'adaptation de la race aux conditions locales.

Cette étude est parmi les premières à utiliser des données de séquençage complet du génome de bovins Créole de Guadeloupe pour détecter des régions abritant des gènes potentiellement impliqués dans leur adaptation. Les résultats obtenus sont d’une grande portée dans le contexte actuel de changement climatique. Ils ouvrent la voie à une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires mis en place par les races locales pour atténuer l’impact des facteurs de stress et apportent des informations utiles pour la conception de futures stratégies de sélection en vue d'une meilleure adaptation, y compris dans les races commerciales.

Pour en savoir plus : Ben-Jemaa S. et al. (2024). Uncovering structural variants in Creole cattle from Guadeloupe and their impact on environmental adaptation through whole genome sequencing. PLOS One, 19(8): e0309411.

Contact

CRB CARARE
UR ASSET
Centre INRAE Antilles-Guyane
Domaine Duclos, Prise d’eau
97170 Petit-Bourg
Région : DOM - Guadeloupe+590 (0)5 90 25 59 00
michel.naves@inrae.fr
Site du CRB

THÉMATIQUES : Animal

COLLECTIONS : Echantillons génétiques et reproductifs des races animales locales des Caraïbes

COORDINATEURS : Michel Naves

RESPONSABLES COLLECTIONS : Nausicaa Poullet et Jean-Luc Gourdine (porcs), Nathalie Mandonnet et Jean-Christophe Bambou (caprins), Michel Naves (bovins et ovins), Carine Marie-Magdeleine (parasites des ruminants)

CERTIFICATIONS :
 

TUTELLES : INRAE

INFRASTRUCTURES NATIONALES : RARe

RÉSEAUX DE CRB IBiSA : CRB-Anim

LABELLISATION IBiSA : 2013

MOTS CLÉS : Race Créole, Génomique, Métagénomique, Transcriptomique, Sang, Tissus, Sperme, Embryons, Adaptation à la chaleur, Résistance aux maladies, Parasitisme interne, Ectoparasites, Résilience, Productivité, Interactions génotype-environnement, Milieu tropical

Fiche mise à jour en 2026

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