APEX

Histopathologie animale et phénotypage tissulaire et cellulaire pour évaluer l’impact d’agents exogènes ou de maladies sur des modèles animaux.

Site de la plateforme

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Histopathologie animale et phénotypage tissulaire et cellulaire pour évaluer l’impact d’agents exogènes ou de maladies sur des modèles animaux.

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Expertise en anatomie pathologique (APEX)

APEX est une plateforme originale associant l’expertise de pathologistes vétérinaires à celle d’ingénieurs spécialisés en bioimagerie de fluorescence. Ses produits et services sont certifiés ISO 9001 et ses pathologistes sont diplômés du Collège européen de leur spécialité, garantissant la conformité de leur savoir-faire vis-à-vis de la réglementation européenne.

Structurée autour d’experts aux compétences complémentaires, APEX propose une offre intégrée en histopathologie vétérinaire et des développements en imagerie de haute technologie, de la molécule à l’animal, sur un large spectre d'espèces animales en réponse aux problématiques de physiopathologie comparée.

Grâce à cette synergie, la plateforme fournit une expertise scientifique dans les domaines de la caractérisation de modèles animaux, la physiopathogénie de maladies infectieuses, le suivi tissulaire et cellulaire d’agents exogènes, le développement d’études précliniques et réglementaires, l’évaluation toxicopathologique de l’impact de polluants environnementaux sur les espèces sentinelles et modèles, la nutrition et la sécurité alimentaire.

Expertises et services

Collaboration ou prestation en histopathologie et bioimagerie de fluorescence,
Développement de multi-marquages pour le phénotypage tissulaire et cellulaire,
Développement de nouvelles méthodologies pour le tracking cellulaire, la préparation des échantillons, la coloration in toto et la transparisation,
Mise à disposition des équipements de la plateforme après formation,
Soutien en analyse d’images,
Conception et organisation de formations en microscopie, histopathologie et immunohistochimie.

Moyens et équipements

Traitement des prélèvements tissulaires :

Automates de déshydratation,
Station d’enrobage-paraffine,
Automate à coloration,
Microtomes rotatifs semi-automatisés,
Vibratome,
Cryostats,
Ultramicrotome,
Microdissecteur laser LMD 7000 (Leica).

Exploration phénotypique tissulaire et cellulaire :

Microscopes motorisés à champ large en lumière blanche Eclipse 90i (Nikon) et en fluorescence Eclipse 80i (Nikon) équipés de caméras à couleurs refroidies,
Station Mantra (Akoya) avec caméra multispectrale et logiciel d'analyse dédié au multiplexing,
Microscope confocal C2 (Nikon) équipé d’un module STORM, de lasers 405, 488, 543 et 647 nm, et d’une caméra sCMOS ORCA-Fusion BT (Hamamatsu),
Microscope biphotonique A1R MP (Nikon) avec 3 détecteurs GaAsps et détecteur PMT en réflexion, 4 détecteuts GaASps en transmission, laser InSight DeepSee (680-1300 nm), sortie fixe à 1040 nm et exploitation double excitation, polarisation linéaire et circulaire, détection des signaux SHG en réflexion et en transmission,
Microscope à feuille de lumière Blaze (Miltenyi) adapté aux échantillons de grande taille et équipé de modules FastTiling et LightSpeed,
Microscope confocal spectral LSM980 (Zeiss) à haute résolution équipé d’un module Airyscan et d’une détection spectrale simultanée du visible à l’infrarouge (405-900 nm),
Microscope de super-résolution Stedycon (Aberrior) avec détection deux couleurs,
Microscope spinning disk X Light-V3 (CrestOptics),
Logiciels dédiés à l’analyse d’images et à la reconstruction 3D : module GA3 de NIS-Elements, ImageJ, Fiji, Qupath, MACS iQ View, Imaris et SyGlass.

<hr>Poisson zèbre : coloration au trichrome de Masson.

<hr>Larve de bar : coloration au rouge d’alizarine et bleu alcian.

<hr>Coupe de moelle épinière de PNH : coloration Kluver-Barrera.

<hr>Nymphe d’abeille domestique : coloration à l’hémalun-éosine-safran.

<hr>Coupe de moelle épinière de primate non humain : marquage GFP en vert et observation en microscopie confocale spectrale.

Comment soumettre un projet ?

La plateforme APEX est ouverte à toutes les équipes de recherche, qu’elles soient académiques ou privées. Tout utilisateur s’engage au préalable à accepter les clauses de la charte des utilisateurs accessible sur le site internet de la plateforme ou sur demande.

Pour faire appel à APEX, adressez une demande, de préférence par mail, à l’un des responsables de la plateforme. Leurs coordonnées sont disponibles sur le site internet. Un plan d’étude sera complété pour servir de support à l’évaluation de la demande par le comité local de gestion et à l’établissement d’un devis dans un délai maximum de trois semaines. La grille tarifaire validée annuellement par les organismes tutélaires est consultable en ligne.

Seules les personnes ayant suivi une formation spécifique dispensée par la plateforme peuvent recevoir une habilitation à utiliser les équipements de façon autonome. Dans les autres cas, les observations et interprétations sont faites directement par l’équipe d’APEX, éventuellement accompagnée par un membre de l’équipe demandeuse, dans le but d’assurer une utilisation optimale des méthodologies et garantir la fiabilité des résultats.

Contact

APEX
UMR0703 PAnTher, INRAE/Oniris
Site de la Chantrerie
Route de Gachet
44307 Nantes
Région : Pays de la Loire+33 (0)2 40 68 40 30
marie-anne.colle@oniris-nantes.fr
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