Pôle de protection des plantes

Le Pôle de protection des plantes (3P) se situe en milieu tropical, sur l’île de La Réunion. Il est dédié à la protection des agrosystèmes et des écosystèmes naturels tropicaux. Outre des serres et des parcelles expérimentales, il met à disposition de ses utilisateurs 19 plateaux techniques de laboratoires confinés. Cette mise à disposition comprend un accès à tous les équipements et à certains consommables, une assistance technique et une expertise en santé végétale.

La plateforme est ouverte à l’ensemble de la communauté scientifique, au niveau local, régional et international. Un projet d’extension et de réhabilitation s’est concrétisé en 2021, lui permettant de proposer à ses utilisateurs une surface d’accueil de plus de 5000 m². Actuellement, le 3P met à disposition 2 600 m² de laboratoires NS2, 105 m² de laboratoires NS3, plus de 600 m² de serres, 75 bureaux supplémentaires et une salle de conférence pouvant accueillir 140 personnes. 

Expertises et services

• Mise à disposition d’un laboratoire de niveau de confinement 3 (NS3), de serres, de chambres climatiques et de différents plateaux de niveau de confinement 2 (NS2) équipés pour la microbiologie, la mycologie, la biologie moléculaire, la culture in vitro, la préparation de milieux cellulaire et lyophilisation, la microscopie, l’entomologie, l’écologie chimique, l’étude des interactions plantes-microorganismes phytopathogènes ou plantes-insectes ravageurs, la stérilisation d’insectes, l’analyse de semences et la conservation de ressources génétiques,
• Mise à disposition de bureaux et de salles pour des conférences ou travaux pratiques, 
• Mise à disposition de l’expertise de la plateforme en agroécologie, bioinformatique, biostatistique, botanique, CIV (dont assainissement), dynamique spatio-temporelle, écologie chimique, écologie de la germination, écologie du paysage, écologie insulaire tropicale, écophysiologie de la dormance, épidémiologie moléculaire, éthologie, évolution moléculaire, génétique des populations, génétique et amélioration des plantes, génomique, transcriptomique et métagénomique, dissémination de phytopathogènes, lutte biologique, évolution et adaptation de communautés phytopathogènes, méthodes et outils de diagnostic, mycologie, phylogénie, phytopathologie, polymorphisme moléculaire, surveillance d’agents pathogènes et revégétalisation de milieux dégradés,
• Réalisation de prestations de service : acquisition d’images, analyse de semences selon les recommandations de l’International seed testing association (ISTA), préparation de milieux de culture et de tampons, aide à l’analyse et au traitement des données.

Moyens et équipements

• Microbiologie : postes de sécurité microbiologiques et chimiques, hottes à flux laminaire, incubateurs, étuves, agitateurs, broyeurs, ensemenceur automatique Spiral, électroporateur, congélateurs à -80°C télésurveillés et sécurisés au CO2 liquide, lecteur ELISA, spectrophotomètres et système d’analyse de croissance bactérienne Bioscreen, centrifugeuse haute capacité et vitesse, 
• Mycologie : postes de sécurité microbiologiques, hottes à flux laminaire, balance, enceintes climatiques et microscope avec capture d’images, 
• Biologie moléculaire : séquenceur 16 capillaires Applied Biosystems 3130XL, thermocycleurs, qPCRs, PCR digitale, systèmes d’électrophorèse QIAxcel , imageur de gels ChemiDoc, centrifugeuses de paillasse SpeedVacs de grande capacité, TapeStation, Qubit et NanoDrop pour la quantification des acides nucléiques, automates d’extraction et de pipetage, 
• Culture in vitro : hottes chimiques et à flux laminaire, loupe binoculaire avec acquisition d’images, chambres de culture, four pasteur et étuve, 
• Espace scientifique partagé : autoclaves, lyophilisateurs, automates de préparation de milieux de culture, hottes chimiques, balances et pH-mètres,
• Microscopie : loupes binoculaires, microscopes, ultramacroscope Nikon AZ100M, microscope Nikon Ni-U, microscope inversé Eclipse TS 2R et stéréomicroscope Nikon SMZ25, 
• Entomologie : armoires climatiques, loupes binoculaires, réfrigérateurs et congélateurs, 
• Ecologie chimique : appareils de chromatographie en phase gazeuse et spectrométrie de masse, équipements pour l’électroantennodétection (EAD) et l’électropénétrographie (EPG), tunnel de vol, olfactomètres et sorbonne, 
• Étude des relations plantes-microorganismes phytopathogènes : chambres climatiques de type rotoplan avec température, hygrométrie et éclairage régulés, 
• Étude des relations plantes-insectes ravageurs : chambres climatiques de type rotoplan et phytoplans avec température, photopériode et hygrométrie régulées, 
• Stérilisation des insectes : stérilisateur XRad320,
• Serres NS2 : tablars et système de cooling. 
• Laboratoire NS3 : chambres climatiques de type phytoplans et rotoplans avec régulation en température, photopériode et hygrométrie,
• Analyse et conservation de semences : humidimètre, compteur à grains, balances, diviseur à rifles et chambre froide de conservation, 
• Analyse et traitement des données : postes informatiques haute performance. 

Comment soumettre un projet ?

Les prestations offertes par le Pôle de protection des plantes (3P) sont décrites sur son site web. Pour soumettre un projet, envoyez un mail à l’adresse contact-3p@cirad.fr en veillant à préciser les laboratoires, serres ou parcelles à utiliser, l’accompagnement attendu, ainsi que les organismes biologiques et les agents chimiques dangereux qui seront manipulés. La demande sera examinée par la direction de la plateforme, qui demandera si besoin un arbitrage au comité de pilotage. Une réponse sera apportée sous un mois. 

Exemple de projet

Analyse des réponses de l’holobionte de l’abeille aux bioagresseurs invasifs 

L’abeille Apis mellifera est une espèce emblématique d’importance écosystémique et économique dont les colonies sont mondialement menacées. Le projet holoBEEont vise à étudier la réponse de l'abeille à son environnement abiotique et à ses bioagresseurs, du point de vue de son holobionte, l’unité fonctionnelle et évolutive composée de l’hôte et de ses partenaires symbiotiques. Il implique cinq partenaires aux expertises nécessaires en génétique des abeilles, analyse du microbiote, surveillance épidémiologique, écologie insulaire et génomique des populations. 

Dans un premier volet, le projet explorera comment les conditions environnementales abiotiques contrastées impactent la diversité et la structure du microbiote des abeilles dans des iles au sud-ouest de l’Océan indien. Dans un deuxième volet, il décrira l'impact des bioagresseurs invasifs sur les holobiontes de l’abeille, par séquençages des génomes des hôtes et des microbiotes, afin d’identifier de potentielles coadaptations hôte-symbiotes. Dans un dernier volet, il examinera comment les bioagresseurs invasifs perturbent la pathosphère des abeilles, en suivant la dynamique des pathogènes de l'abeille à La Réunion et en comparant la virulence de souches introduites de virus des ailes déformées (DWV) entre les sous-espèces. 

Le projet holoBEEont apportera un nouvel éclairage sur les réponses de l’holobionte de l’abeille aux perturbations biotiques et abiotiques, en produisant des données originales, indispensables à l’amélioration de la conservation et de la gestion des abeilles dans un environnement changeant. Les laboratoires du 3P, notamment l’espace de biologie moléculaire, le NS3, les stations expérimentales et l’espace scientifique partagé sont mis à disposition des scientifiques pour mener à bien leurs travaux. Le 3P permet à l’ensemble des acteurs de travailler sur site, favorisant les interactions entre les partenaires du projet. Sa proximité avec le terrain leur offre également la possibilité d’étudier les abeilles à la fois en laboratoire et dans leur environnement.

Contact

Pôle de protection des plantes (3P)
7 chemin de l’Irat, Ligne Paradis
97410 Saint-Pierre
Région : DOM - La Réunion+262 (0)2 62 49 27 00
contact-3p@cirad.fr
Site de la plateforme

THÉMATIQUES : Expérimentation végétale

RESPONSABLES SCIENTIFIQUES :
Hélène Delatte

RESPONSABLES TECHNIQUES :
Jérémy Hascoat

RESPONSABLES QUALITÉ :
Sandra Fourré

CERTIFICATIONS :
 

TUTELLES : Cirad, Université de La Réunion

LABELLISATION IBiSA : 2009

MOTS CLÉS : Phytopathologie, Niveaux de confinement 2 et 3, Environnement tropical, Biologie moléculaire, Génotypage, Ecologie chimique, Microbiologie, Mycologie, Culture in vitro, Physiologie végétale, Lutte biologique, Diagnostic, Analyse de semences, Pathogènes, Ravageurs, Analyse de fragments, Electroantennodétection, Chromatographie, Spectrométrie de masse, PCR quantitative, Chambres climatiques

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