IMAG’IC

Un ensemble de 16 systèmes d'acquisition pour l’imagerie cellulaire : plein champ, confocal, super-résolution, multi-photon, spectral, intra-vital, SHG, FLIM, TIRF, imagerie en flux et light sheet.

Site de la plateforme

IMAG’IC

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IMAG’IC

La plateforme d’imagerie cellulaire IMAG’IC de l’Institut Cochin est une composante de l’infrastructure nationale France-BioImaging. Localisée en plein cœur de Paris et répartie sur 200 m², elle compte 16 systèmes d'acquisition : plein champ, confocal, super-résolution (PALM, STORM, STED, ExM), multi-photon, spectral, intra-vital, SHG, FLIM, TIRF, FRET-FLIM, imagerie en flux et light sheet. Elle est également équipée de 3 stations d'analyse et de traitement d'images.

Toute personne dépendant d'un laboratoire public ou privé peut bénéficier d'une assistance ou d'une formation pour devenir autonome sur les microscopes gérés par la plateforme. En parallèle, IMAG'IC propose des prestations de restauration d’images par déconvolution 3D, de construction de bases de données, d'impression 3D, de coupe épaisse de tissus par vibratome et de clarification de tissus.

Expertises et services

Mise à disposition de l’ensemble des systèmes d’acquisition après formation,
Coupe de tissus humains ou murins, fixés ou perfusés, et évaluation par des techniques de FRET ou calcium,
Clarification de tissus et d'organes,
Imagerie intra-vitale (anesthésie, chirurgie, contraste SHG) sur modèles murins, poissons, ovo,
Microscopie de super-résolution : PALM, STORM, STED et ExM,
Microscopie light sheet,
Imagerie en environnement confiné de niveau 2 et 3 pour l’étude d’interactions hôte-pathogène, de cellules et tissus humains ou murins infectés,
Analyse, traitement et quantification d’images,
Création de workflow d'analyse d'images Imaris, Cellpose, Qupath, Arivis, Huygens, Matlab et Cochin Image Database,
Sauvegarde et archivage d’images, archivage collaboratif, annotation et visualisation d’images pyramidales, restauration d'images par déconvolution 3D en ligne.

Moyens et équipements

Imagerie en flux :

ImageStreamX.

Microscopie de super-résolution :

Leica GSD STORM PALM sptPALM TIRF,
Leica STED FLIM FALCON en confinement L2.

Microscopie confocale :

Leica spinning-disk X1 en confinement L1,
Olympus IXplore spinning-disk W1 en confinement L1,
Leica spinning-disk X1 en confinement L2,
Leica spinning-disk X1 en confinement L3,
Leica multi-photon SP8 DIVE spectrale FALCON FLIM SHG en confinement L2,
Leica multi-photon SP5 FRET SHG en confinement L1.

Microscopie plein champ :

TILL Photonics iMIC, TIRF, FRAP et PA-GFP,
Leica DMI6000,
Zeiss Observer Z1 FRET Ca²⁺,
Zeiss AxioVert 200M FRET,
Olympus BX63F.

Autres équipements :

Zeiss Lightsheet 7,
Macroscope et loupe Nikon,
Imprimante 3D Polyjet.

<hr>Muscle observé en microscopie multi-photonique et SHG. © IMAG’IC, P. Maire, T. Guilbert.

<hr>Microtubules observés en microscopie de super-résolution dSTORM 3D. © IMAG’IC, B. Durel.

<hr>Cytosquelette observé en microscopie plein champ. © IMAG’IC, L. Ghouinem.

<hr>Microscopie plein champ avec déconvolution. © IMAG'IC, Cochin Image Database.

<hr>Intestin observé en microscopie multi-photonique et SHG. © IMAG’IC, T. Guilbert, MISC, N. Chevalier.

<hr>Fibre musculaire observée en microscopie plein champ. © IMAG’IC, M. Dos-Santos.

<hr>Tumeur sur glande mammaire observée en microscopie multi-photonique, SHG et THG. © IMAG’IC, T. Guilbert.

Comment soumettre un projet ?

Pour soumettre un projet ou une demande à IMAG’IC, vous pouvez envoyer un mail à l’adresse générique u1016-imagic@inserm.fr. L’équipe de la plateforme vous recontactera rapidement pour vous préciser la suite des opérations.