Accueil Site » Retour liste annuaire » plateforme : ScreenTECH GE

ScreenTECH GE
Responsable : VILLA Pascal et BRINO Laurent • Responsable Tech. : VILLA Pascal, Plate-forme de chimie biologique intégrative de Strasbourg (PCBIS) BRINO Laurent, Criblage phénotypique à Haut débit IGBMC (HTSF)
Adresse : PCBIS : 300 Boulevard Sébastien Brant
HTSF : BP10142, 1 rue Laurent Fries
67400 Illkirch

complements

Certifications


Plate-forme certifiée ISO 9001

Site web

http://www.screentech-ge.fr (en construc...

Presentation de la plate-forme

1) Site PCBIS : Plate-forme dont les services sont répartis dans 2 bâtiments éloignés de 300 mètres (Faculté de pharmacie et ESBS) (9.7 ETP)

a. Service Chimiothèque (Faculté de Pharmacie)

Cette unité fonctionnelle gère les chimiothèques (Chimiothèque Nationale, Prestwick, CNE, substances naturelles), leur contrôle qualité et le suivi de la re-synthèse de touches après criblage. Cette unité est devenue le centre référent Français pour collecter, mettre en plaques et effectuer le contrôle Qualité des molécules de la Chimiothèque Nationale Essentielle (CNE). C'est également un centre de référence Européen.

b. Criblage de molécules et Ciblothèque (ESBS)

La plate-forme de criblage de molécules propose les prestations suivantes (tarifs préférentiels pour les laboratoires publics; coût complet pour les sociétés privées):
• Formation et supervision des étudiants et chercheurs dans le cadre de projets de criblage (aide à la miniaturisation et mise au point de modèles biologiques)
• Développement de tests miniaturisés
• Formation des utilisateurs d'instruments et technologies disponibles dans le service.
• Activités de consultance

Systèmes biologiques proposés:

Dans un souci de performance et pour se différencier des plates-formes privées tout en favorisant une synergie avec les plates-formes du système académique existant nous nous spécialisons dans deux types de tests génériques:
• Ces tests génériques permettent de détecter les interactions entre une protéine et une petite molécule. Le premier test générique est basé sur le principe du transfert d'énergie de fluorescence pour les protéines membranaires liées à la protéine verte fluorescente (GFP) surexprimées dans des cellules HEK293. Le deuxième test utilise l'anisotropie de fluorescence pour cribler des protéines solubles recombinantes purifiées.
• Nous avons aussi développé et validé plusieurs tests génériques permettant de suivre différents signaux dans les cellules vivantes (notamment dans les cellules souches) tels que les tests de prolifération, mesure de flux calcique, mesure de survie et mort cellulaire, mesure de la sécrétion de cytokines par les cellules et l'expression de différents gènes utilisant la protéine GFP comme gène rapporteur. Cette liste n'est pas exhaustive et est en constante augmentation.

c. Technologies du médicament (ESBS et Faculté de Pharmacie)

Ce service évalue les propriétés ADME des molécules actives:
- profil physicochimique complet (solubilité, log D, pKa, stabilité chimique)
- tests in vitro permettant une détermination rapide des paramètres d'ADME (Perméabilités (PAMPA, caco-2), Liaison aux protéines plasmatiques, Stabilité plasmatique, Métabolisme in vitro (microsomes, fraction S9, CYP recombinants), interactions médicamenteuses (induction des cytochromes P450))
- Pharmacocinétique in vivo chez la souris, passage de la barrière hémato-encéphalique

2) Site HTSF, IGBMC (4 ETP)

Criblage cellulaire phénotypique en microplaques par siRNA/ARN interférence et crRNA/CRISPR editing
Criblage cellulaire phénotypique en microplaques par traitement chimique
Criblage cellulaire de banques lentivirales poolées (CRISPR, shRNA)
Acquisition en fluorescence d'images de cellules de mammifères sur lecteurs Cellomics HCS (fluorescence)
Acquisition de données cellulaires sur lecteur Berthold Mithras LB940 HTS (reporters, viabilité, ELISA)
Analyse de haut contenu cellulaire à haut débit (CellProfiler, Cellomics bioapplications)
Analyse de données HCS/HTS et de séquençage NGS (criblages lentiviraux poolés)

Moyens et equipements

1) PCBIS
Equipements principaux service criblage
• Une chaîne robotisée (Beckman Coulter) composée de robots (BIOMEK FX-96-384 et BIOMEK NX), un BRT manipulateur de plaques et servo shuttle, un carrousel de stockage, code à barre et deux lecteurs associés
(Flexstation III et Envision (Molecular devices et Perkin elmer) (acquisitions 2007-2010-2011), un incubateur (cytomat, 2012) et multidrop
• Un robot BIOMEK FX 96 pointes (Beckman-Coulter) (acquisition 2007), et 2 Biomek 2000, + 1 Biomek 4000 (en cours d’acquisition)
• plusieurs lecteurs de plaques multifonction: VictorLight, Microbeta, Victor3 (Perkin Elmer).
• Deux plafonds à flux laminaire qui recouvrent les robots pour pouvoir travailler de manière stérile (acquisition 2004 et 2007),
• Un lecteur de diffusion dynamique de la lumière (DLS) DynaPro (acquisition 2009),
• Un appareil de mesure de croissance cellulaire et de mesure de fluorescence cellulaire dans un incubateur à cellules Incucyte (acquisition 2009),
• Un appareil de mesure en microfluidique développé dans le cadre de la R&D (2012-2013)
• Un lecteur de plaques technologie label free (EPIC) (Enspire, Perkin Elmer; acquisition 2012)

Equipements du service Chimiothèque:

Système simple quadripôle:
• HPLC 1200SL Agilent avec la configuration suivante : pompe binaire, injecteur automatique réfrigéré (vials et/ou plaques 96 puits), four à colonne et DAD.
• MSD Agilent 1200SL (gamme de masse de 0 à 3000 uma; acquisition 2006)).
Sources disponibles
• Multimode ESI/APCI Agilent
• ESI Agilent
• APPI Agilent
• Un robot de pipetage BIOMEK 2000 (Beckman Coulter) (acquisition 1999)

Equipements du service Technologies du médicament:

• LC/MS/MS triple quad (Shimadzu) (acquisition 2011)
• Appareil de mesure de pKa en plaque 96 (acquisition 2009)
• 2 HPLC
• Une centrale microlide, un automate d’inclusion et un automate de coloration ;
• Un système flexivent
• Un plethysmographe
&
8679; Note : Nature des principaux équipement, précisez la date d'acquisition de chacun. A partir de 150 000 euros.


2) HTSF, IGBMC:
Robot de criblage 96 Freedom EVO150-PW96 TECAN (sous PSM classe 2), acquisition 2006 mais upgradé
Station automatisée de criblage 96/384 Biocel Agilent/Thermo (sous PSM classe 2)*, acquisition 2013
3 lecteurs Cellomics HCS : CX7***, CX5** et Arrayscan XTi** module Live+

* Robot INGESTEM (accès libre à la plateforme de criblage de l'IGBMC)
** Les lecteurs CX5 et XTi sont intégrés au Biocel
*** Le lecteur CX7 est intégré au bras Orbitor (transfert de MTPs)

Galerie

Aucun visuels disponibles.