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Clic-Imaging
Responsable : Isabelle Fournier • Responsable Tech. : Co-Responsable (scientifique) : Maxence Wisztorski (30%) Responsable Technique: Jean-Pascal Gimeno (100%)
Adresse : Clic-Imaging
Laboratoire Prism Inserm U1192
Bât SN3, 1er étage
Campus Cité Scientifique, Université de Lille
59655 Villeneuve d'Ascq Cedex
59655 Villeneuve d'Ascq

complements

Certifications

Pas de certification ISO

Site web

http://laboratoire-prism.fr/index.php/pl...

Presentation de la plate-forme

La plateforme Clic-Imaging offre des prestations dans le domaine de l'imagerie moléculaire par Spectrométrie de Masse et la protéomique tissulaire (spatially resolved proteomics) pour les applications en biologie et en clinique.
Cette offre de service est accessible aux laboratoires académiques, cliniques et industriels.
La plateforme prend en charge les analyses de la préparation d'échantillon au traitement des données. Dans le cadre de l'imagerie par spectrométrie de masse, la plateforme assure la préparation de la congélation initiale de l'échantillon au dépôt de la matrice.
-Imagerie par spectrométrie de masse sur tissus de biomolécules endogènes (métabolites, lipides, peptides, protéines) sur coupes de tissus congelés et/ou fixés (FFPE) à partir de matériel végétal, animal ou humain (biopsies, banques hospitalières de tissus) ainsi que cultures en sphéroïdes 3D avec source MALDI et DESI.
-Imagerie par spectrométrie de masse de composés exogènes (médicaments, xénobiotiques) avec source MALDI et DESI
-Imagerie par spectrométrie de masse tridimensionnelle (3D MS Imaging)
-Histologie moléculaire utilisant les données d'imagerie MS.
-Identification des composés (lipides et protéines) observés dans des régions d’intérêts définies à partir des données d'imagerie, en utilisant des techniques de microextractions de surface couplées aux analyses de protéomique ou de lipidomique à grande échelle.
-Interprétation des données d'imagerie MS (Histologie moléculaire, analyses statistiques).
La plateforme peut également prendre en charge des analyses en protéomique haut débit.
-Préparation et analyse de vésicules extracellulaires (e.g. exosomes).
-Protéomique Shot-Gun et Top-Down
-Protéogénomique (Ghost proteome)

Moyens et equipements

Spectrométrie de Masse (6)
-MALDI-TOF/TOF Ultraflex II (2006, Bruker Daltonics),
-MALDI/ESI LTQ-Orbitrap XL (2011, Thermo Scientific),
-ESI Q-orbitrap Q-Exactive (2014, Thermo Scientific),
-ESI- Q-TOF with Ion mobility and ETD SYNAPT G2S (2014, Waters)
-MALDI-ReTOF Imagerie Haut Débit RapiFlex (2017, Bruker)
-ESI/DESI/REIMS-QTOF Xevo (2018, Waters)

Chromatographies (4)
-Nano-LC EASY-nLC II (2013, Thermo Scientific),
-Nano-UHPLC EASY-nLC 1000 (2014, Thermo Scientific),
-Nano-UPLC ACQUITY (2015, Waters),
-HPLC Serie 200 (2003, Perkin Elmer)

Electrophorèse (1)
-CZE ProteoLab PA 800 (2011, Beckmann Coulter)

Systèmes de Préparation d'échantillons (7)
-Solvent Microsprayer Imageprep (2009, Bruker Daltonics)
-Chemical Inkjet Printer CHIP1000 microspotter (2010, Shimadzu)
-Triversa Nanomate with LESA option (2012, Advion) and LESAplus (2016, Advion),
-Solvent Microsprayer TM-Sprayer M3 (2018, HTXImaging, leasing)
-Système de sublimation manuel (Sigma-Aldrich)
-Cryostat (2006, Leica)
-Antigen retrieval system

Bioinformatique:
-Data server DELL PowerEdge T430 RAID6 32To (2015, Dell), Proteome Destroyer with 64 Gb quad channel DDR3 RAM and 12 core processor (2014, OmicsComputing), Calculator Station with GPU Nvidia Tesla K20c (2015, Lenovo)
-FlexImaging 4 (2015, Bruker Daltonics), SCiLS Lab (2014, SCils)
-Proteome Discoverer 2.1 (2016, Thermo Scientific) with XLinkX (2018), ProSightPD 1.1 (2016), Scaffold 4.6 and perSPECtives (2014, Proteome Software), Progenesis QI and Progenesis QI for Proteomics (2014, 2019, Nonlinear Dynamics), Maxquant and Perseus

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