• Découvrir IBiSA

    • Objectifs et missions

    • Équipe et organisation

    • La mission qualité

    • Actualités
  • Trouver une structure

    • Annuaire des plateformes

    • Annuaire des CRB
  • Candidater à un appel d'offres

    • Les appels d'offres IBiSA

    • Appel d'offres Plateformes

    • Appel à projets CRB

iGenSeq

Tout pour le séquençage à haut débit, du design des projets à leur réalisation, jusqu'à la fourniture des fichiers fastq.

Site de la plateforme

iGenSeq

Tout pour le séquençage à haut débit, du design des projets à leur réalisation, jusqu'à la fourniture des fichiers fastq.

Site de la plateforme

iGenSeq

iGenSeq est une plateforme technologique ouverte aux laboratoires académiques, aux services hospitaliers et aux partenaires industriels. Localisée à l’Institut du cerveau (ICM) sur le site de l’Hôpital de la Pitié-Salpêtrière à Paris, elle fournit à ses utilisateurs des outils et services pour l’analyse des acides nucléiques.

Créé en 2011 à l’ouverture de l’Institut, la plateforme s’est spécialisée dans les prestations de séquençage à haut débit et a évolué pour répondre aux projets de pointe en génomique. Son équipe est composé de 7 personnels permanents, garantissant la pérennité de son savoir-faire et de son expertise. Tous les membres d’iGenSeq sont formés à l’ensemble des activités de la plateforme afin de maintenir la continuité permanente des services proposés.

Expertises et services

  • Réalisation de génomes (toutes espèces) et d’exomes (humains et souris),
  • Methyl-Seq, ChIP-Seq, ATAC-Seq, CLIP-Seq, CUT&Tag-Seq à partir d’acides nucléiques purifiés,
  • RNA-Seq (3’, low input, FFPE, mRNA, ribodepletion) et small RNA-Seq,
  • Analyse sur cellule unique (single cell),
  • PCR en temps réel (qPCR) à haut débit et PCR digitale en gouttelettes,  
  • Identitovigilance pour la sécurisation des données des patients,
  • Accompagnement sur le design de projets,
  • Mise à disposition des équipements.

Moyens et équipements

  • Séquenceurs NovaSeq 6000, NextSeq 500 et MiSeq (Illumina),
  • Chromium Controller (10x Genomics),
  • LightCycler 96 et 384 (Roche),
  • Biomark HD (Fluidigm),
  • Droplet Digital PCR (Bio-Rad).

Retrouvez toutes les actualités d'IBiSA

Inscrivez-vous à la newsletter

Comment soumettre un projet ?

Pour soumettre un dossier ou un projet à iGenSeq, vous pouvez passer par le site web de la plateforme ou vous adresser directement à son responsable, Yannick Marie.

Contact

iGenSeq
Institut du cerveau (ICM)
Hôpital de la Pitié-Salpêtrière
47 boulevard de l’Hôpital
75013 Paris
Région : Île-de-Franceyannick.marie@icm-institute.org
Site de la plateforme

iGenSeq

 

THÉMATIQUES : Génomique, transcriptomique

TUTELLES : CNRS, Inserm, Sorbonne Université

INFRASTRUCTURES NATIONALES : France Génomique

LABELLISATION IBiSA : 2021

CERTIFICATIONS :
 

RESPONSABLES SCIENTIFIQUES :
Stéphanie Baulac

RESPONSABLES TECHNIQUES :
Yannick Marie

RESPONSABLES QUALITÉ :
Laurine Lenoir

MOTS CLÉS : NGS, Séquençage haut debit, Single cell, Illumina, Préparation de librairies, Ready to seq, Ready to load, Short reads, ARN, ADN, NovaSeq 6000

Fiche mise à jour en 2022


Suivre les
actualités des
plateformes

GIS IBiSA

Infrastructures de recherche
en biologie, santé et agronomie

147 rue de l'Université
75007 Paris

+33 (0)1 42 75 91 55
secretariat@ibisa.net

Découvrir IBiSA

Objectifs et missions
L'équipe IBiSA

Les services IBiSA

Trouver une plateforme
Trouver un CRB
Candidater à un appel d'offres
Demander un soutien qualité

Quoi de neuf à IBiSA ?

Les actualités d'IBiSA
Calendriers des appels d'offres
Inscription à la newsletter

© IBiSA 2023 I Contact I Mentions légales I Plan de site