Image analysis hub (IAH)
Développement d’outils d’analyse d’images biologiques personnalisés pour l’imagerie quantitative.
Image analysis hub (IAH)
Développement d’outils d’analyse d’images biologiques personnalisés pour l’imagerie quantitative.
Image analysis hub (IAH)
L’IAH est une plateforme technologique dédiée à l’analyse d’images biologiques. Créée en 2017 et ouverte à l’ensemble de la communauté scientifique, elle propose des services en analyse et quantification d'images de microscopie du vivant. Ses ingénieurs collaborent avec ses utilisateurs pour apporter une valeur significative à leurs travaux de recherche.
Dans le cas d’un projet de quantification par exemple, la plateforme peut mettre au point ou adapter un pipeline d’analyse pour extraire des données quantitatives des images du projet, effectuer l'analyse des images jusqu'à l'interprétation scientifique, mais aussi s’impliquer sur la production d'une figure ou la rédaction d’une publication visant à valoriser les résultats.
L’IAH s’investit également sur le développement d'outils d'analyse personnalisés. La plateforme optimise les logiciels d’analyse d’images qu’elle utilise et en conçoit de nouveaux, comme TrackMate, MaMuT et Mastodon, déjà exploités dans de nombreux projets. Elle est par ailleurs impliquée dans deux grands projets logiciels en imagerie : Fiji et Icy. Enfin, elle met à disposition de ses utilisateurs des stations de travail puissantes équipées des logiciels d’analyse commerciaux du domaine et facilite l’accès aux ressources de calcul intensif du campus de Pasteur.
Expertises et services
- Conseil et formation à l’analyse d’images biologiques,
- Conception et déploiement d’outils d'analyse personnalisés,
- Accès à des logiciels d’analyse biologique via une infrastructure d’analyse d’images autonome,
- Développement d’outils logiciels originaux et innovants pour l'analyse d'images.
Moyens et équipements
- Imaris de BitPlane,
- Huygens de SVI,
- Arivis Vision4D.
Comment soumettre un projet ?
Pour soumettre un projet à l’IAH, rendez-vous à l’une des journées portes ouvertes de la plateforme. Elles ont lieu le jeudi matin de 9h30 à 12h30, une semaine sur deux. Pour plus d’informations, consultez la page dédiée sur le site internet.
Contact
Image analysis hub (IAH)
Institut Pasteur
25-28 rue du Docteur Roux
75015 Paris
Région : Île-de-France
+33 (0)1 45 68 82 18
iah@pasteur.fr
Site de la plateforme
THÉMATIQUES : Autres
RESPONSABLES SCIENTIFIQUES :
Jean-Yves Tinevez
RESPONSABLES TECHNIQUES :
Jean-Yves Tinevez
RESPONSABLES QUALITÉ :
Jean-Yves Tinevez
TUTELLES : Institut Pasteur
INFRASTRUCTURES NATIONALES : France BioImaging
LABELLISATION IBiSA : 2019
MOTS CLÉS : Analyse d’images biologiques, Développement logiciel, Quantification, Imagerie quantitative, Suivi de particule unique, Détection d’objets, Segmentation d’objets, Logiciels d’analyse d’images, Imaris, Huygens, Arivis, Déconvolution, Visualisation d’images, Fiji, Icy
Fiche mise à jour en 2021
