Metabolomics analysis of small-molecule signatures (MASS)

Une expertise en métabolomique et spectrométrie de masse pour l’analyse de métabolites dans les échantillons biologiques.

Site de la plateforme

Metabolomics analysis of small-molecule signatures (MASS)

Une expertise en métabolomique et spectrométrie de masse pour l’analyse de métabolites dans les échantillons biologiques.

Site de la plateforme

Metabolomics analysis of small-molecule signatures (MASS)

Adossée à l’Institut de biologie moléculaire des plantes (IBMP), la plateforme MASS est spécialisée en métabolomique. Elle analyse des petites molécules bioactives (< 1 000 Da) comme les lipides, les sucres, les acides aminés et les acides nucléiques. La plateforme travaille essentiellement sur des échantillons végétaux, fongiques et bactériens. Elle propose des analyses ciblées de molécules d’intérêt, même en faible quantité, et des analyses non ciblées pour des projets d’exploration du métabolisme. La plateforme est ouverte à tous les laboratoires en France, en Europe et à l’étranger. Elle est engagée dans une démarche qualité pilotée par l'Université de Strasbourg.

Expertises et services

Analyse ciblée et non ciblée par spectrométrie de masse : LC-MS/MS à haute et basse résolution, GC-MS/MS,
Profilage hormonal (hormonomique), profilage lipidique (lipidomique), profilage de métabolismes primaires et secondaires,
Prise en charge complète de projets : montage, design expérimental, préparation des échantillons, analyse et traitement des données,
Formation : préparation d’échantillons, métabolomique ciblée et non ciblée, imagerie par spectrométrie de masse, traitement de données, utilisation d’outils statistiques, recherche dans des bases de données, création de réseaux moléculaires et lien avec les autres omiques.

Moyens et équipements

LC-UV-MS/MS-TQ Quattro Premier (Waters),
LC-UV-MS/MS-TQ EVOQ (Bruker),
GC-MS/MS-TQ Scion (Bruker),
LC-MS/MS-Q-TOF Impact II (Bruker),
HPLC-DAD-ESI-Q avec collecteur de fractions (Waters),
ESI-MALDI-FT-ICR SolariX 7T (Bruker),
HTX M5 Sprayer (HTX Technologies),
ImagePrep (Bruker),
LESA (Advion),
Cryomicrotome (Thermo Scientific),
SpeedVac (Thermo Scientific).

<hr>Arrivée par les airs du spectromètre SolariX 7T (Bruker).

<hr>Image moléculaire d’une coupe de tige obtenue par MALDI imaging.

<hr>Processus de retraitement de données en MALDI imaging.

<hr>Processus d’analyse complet en MALDI imaging de plantes.

<hr>Retraitement de données en MALDI imaging.

<hr>Distribution de molécules d’intérêt dans une tige de roseau obtenue par MALDI imaging.

Comment soumettre un projet ?

Pour soumettre un projet à la plateforme MASS, vous pouvez envoyer votre demande par mail aux responsables scientifiques, à l’adresse mass@ibmp-cnrs.unistra.fr. Une étude de faisabilité sera réalisée par la plateforme, ainsi que des essais de mise au point si nécessaires. Les analyses seront lancées à réception des échantillons, selon un calendrier discuté préalablement. Des revues de projet pourront également avoir lieu aussi souvent que souhaité. La plateforme participe à la valorisation des projets sur lesquels elle intervient.