Plant imaging and mass spectrometry (PIMS)

Une expertise en métabolomique et imagerie par spectrométrie de masse pour l’analyse de molécules bioactives et xénobiotiques dans les échantillons biologiques et environnementaux.

Site de la plateforme

Plant imaging and mass spectrometry (PIMS)

Une expertise en métabolomique et imagerie par spectrométrie de masse pour l’analyse de molécules bioactives et xénobiotiques dans les échantillons biologiques et environnementaux.

Site de la plateforme

Plant imaging and mass spectrometry (PIMS)

Adossée à l’Institut de biologie moléculaire des plantes (IBMP), la plateforme PIMS est spécialisée en métabolomique. Elle analyse des petites molécules bioactives (< 1 000 Da) comme les lipides, les sucres, les acides aminés et les acides nucléiques, mais aussi des xénobiotiques, comme les médicaments, les pesticides et autres polluants industriels. La plateforme travaille sur des échantillons végétaux, animaux, humains, bactériens, issus de l’eau ou du sol. Elle propose des analyses ciblées de molécules d’intérêt, même en faible quantité, et des analyses non ciblées pour des projets d’exploration du métabolisme. PIMS maîtrise les techniques d’imagerie par spectrométrie de masse, permettant la localisation spatiotemporelle des métabolites sur des tissus intacts. La plateforme est ouverte à tous les laboratoires en France, en Europe et à l’étranger.

Expertises et services

Analyse ciblée et non ciblée par spectrométrie de masse : LC-MS/MS à haute et basse résolution, GC-MS/MS, MALDI et MALDI imaging,
Etude de l’exposome (micropollutants) et de la réponse biologique associée,
Profilage hormonal (hormonomique), profilage lipidique (lipidomique), profilage de métabolismes primaires et secondaires,
Prise en charge complète de projets : montage, design expérimental, préparation des échantillons, analyse et traitement des données,
Formation : préparation d’échantillons, métabolomique ciblée et non ciblée, imagerie par spectrométrie de masse, traitement de données, utilisation d’outils statistiques, recherche dans des bases de données, création de réseaux moléculaires et lien avec les autres omiques.

Moyens et équipements

LC-UV-MS/MS-TQ Quattro Premier (Waters),
LC-UV-MS/MS-TQ EVOQ (Bruker),
GC-MS/MS-TQ SCION (Bruker),
LC-MS/MS-Q-TOF Impact II (Bruker),
HPLC-DAD-ESI-Q avec collecteur de fractions (Waters),
ESI-MALDI-FT-ICR SolariX 7T (Bruker),
HTX M5 Sprayer (HTX Technologies),
ImagePrep (Bruker),
LESA (Advion),
Cryomicrotome (Thermo Scientific),
2 SpeedVac (Thermo Scientific).

<hr>Arrivée par les airs du spectromètre SolariX 7T (Bruker).

<hr>Image moléculaire d’une coupe de tige obtenue par MALDI imaging.

<hr>Processus de retraitement de données en MALDI imaging.

<hr>Processus d’analyse complet en MALDI imaging de plantes.

<hr>Retraitement de données en MALDI imaging.

<hr>Distribution de molécules d’intérêt dans une tige de roseau obtenue par MALDI imaging.

Comment soumettre un projet ?

Pour soumettre un projet à la plateforme PIMS, vous pouvez envoyer votre demande par mail au responsable scientifique et technique, Dimitri Heintz. Une étude de faisabilité sera réalisée par la plateforme, ainsi que des essais de mise au point si nécessaires. Les analyses seront lancées à réception des échantillons. Les résultats seront livrés sous 30 à 60 jours. Des revues de projet pourront également avoir lieu aussi souvent que souhaité. La plateforme participe à la valorisation des projets sur lesquels elle intervient.