stemCARE

Production et utilisation de cellules souches pluripotentes humaines comme modèles cellulaires pour la recherche pharmacologique et comme produits pour la thérapie cellulaire.

Site de la plateforme

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Production et utilisation de cellules souches pluripotentes humaines comme modèles cellulaires pour la recherche pharmacologique et comme produits pour la thérapie cellulaire.

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Stem cells applications in research (stemCARE)

La plateforme stemCARE offre aux groupes de recherche intéressés par les maladies génétiques au niveau national, une expertise de pointe et des méthodologies standardisées en matière de production de cellules souches pluripotentes (CSP), de différenciation, de reconstruction tissulaire 2D et 3D, ainsi que d’analyses multiparamétriques et « omics ». Elle regroupe un ensemble de technologies pilotées par l’Equipe innovation et recherche technologique (eRIT), composée d’une quinzaine de chercheurs, ingénieurs et techniciens. L’expertise et les équipements de StemCARE sont ouverts aux équipes extérieures souhaitant intégrer l’utilisation des CSP comme modèles d’étude et de criblage de molécules dans leurs développements précliniques.

La plateforme stemCARE est organisée autour de six plateaux technologiques incluant l’édition du génome, la culture et le banking de cellules souches pluripotentes, la bioproduction automatisée, l’analyse transcriptomique, l’imagerie à haute résolution, haut débit et haut contenu pour le phénotypage cellulaire et le criblage de médicaments.

Expertises et services

Edition du génome par CRISPR dans les cellules souches embryonnaires,
Culture de cellules souches embryonnaires et constitution de petites banques de cellules avec contrôle qualité complet comprenant la quantification en cytométrie de l'expression des marqueurs membranaires, l'analyse SNP, le caryotypage mFISH et l'immunofluorescence,
Analyse de caryotypes pour la caractérisation de lignées cellulaires produites en dehors de la plateforme,
Bioproduction automatisées de cellules souches pluripotentes pour la constitution de grandes banques de cellules avec contrôle qualité complet,
Analyse transcriptomique,
Mise à disposition en autonomie ou avec supervision des systèmes d'imagerie à haute résolution ou des systèmes d'imagerie à haut débit et haut contenu pour le phénotypage cellulaire impartial et le criblage de médicaments,
Développement de tests cellulaires miniaturisés et automatisés avec plaques de 384 puits et criblage de médicaments à haut débit jusqu'à 100 000 molécules, avec mise à disposition d’une collection de 4 000 médicaments approuvés par la FDA et l’EMA.

Moyens et équipements

Cytomètres Macsquant (Miltenyi) et trieurs de cellules F.Sight (Cytena),
Automates de bioproduction Prodigy (Miltenyi) et CompacT SelecT (Sartorius),
Séquenceurs de nouvelle génération (Illumina) et système de préparation de librairies pour scRNA-Seq (10x Genomics),
Microscopes confocaux et spinning disk (Zeiss) pour l’imagerie à haute résolution,
Systèmes CX7 et ArrayScan VTI (Thermo Fisher), IMX (Molecular Devices) et FDSS (Hamamatsu) pour l'imagerie multiparamétrique à haut contenu,
Automates BioCell 1800 (Agilent) et système de nano-distribution Echo (Labcyte inc.) combiné à des appareils de manipulation de liquides Biomek (Beckman) pour la manipulation de liquides à haut débit dédiés au criblage de médicaments.

Comment soumettre un projet ?

Pour soumettre un projet à stemCARE, vous pouvez envoyer un mail à Alexandra Benchoua, responsable scientifique de la plateforme. Vous serez recontacté dans les 48 heures pour convenir d’une réunion visant à définir vos attentes ou mettre en place un plan d’action répondant à vos objectifs. En fonction de vos besoins, la plateforme pourra éditer un devis de prestation ou participer à l’écriture de demandes de financement. Pour des besoins ciblés, vous pouvez aussi contacter directement les responsables des différents plateaux dont l’adresse est indiquée sur le site de stemCARE et celui du laboratoire I-Stem.

Exemple d'utilisation

Criblage de molécules thérapeutiques pour l’autisme

La plateforme stemCARE a collaboré avec le consortium privé Ksilink de Strasbourg pour créer de nouveaux modèles dérivés de cellules souches pluripotentes (CSP) issues de patients présentant des troubles autistiques liés à haploinsuffisance en SHANK-3. Elle a ensuite réalisé le criblage à haut débit d'une bibliothèque composée de plus de 7 000 molécules potentiellement capables de restaurer les circuits neuronaux dans ces troubles autistiques. Le projet démarré en 2020 a donné lieu à plusieurs publications et permis d’identifier une nouvelle molécule candidate pour améliorer les atteintes développementales dans le syndrome de Phelan-McDermid (PMDS), une forme rare d’autisme d’origine génétique.

Pour en savoir plus : Thibaudeau A. et al. (2024). Pharmacological modulation of developmental and synaptic phenotypes in human SHANK3 deficient stem cell-derived neuronal models. Translational Psychiatry, 14(1):249.