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Transgénèse rat et immuno-phénomique (TRIP)

Une expertise de pointe et un savoir-faire unique dans le domaine de la transgenèse chez le rat, de l’immunologie et de la transplantation.

Site de la plateforme

Transgénèse rat et immuno-phénomique (TRIP)

Une expertise de pointe et un savoir-faire unique dans le domaine de la transgenèse chez le rat, de l’immunologie et de la transplantation.

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Transgénèse rat et immunophénomique (TRIP)

La plateforme TRIP est la seule structure académique en France et l’une des rares en Europe à posséder un savoir-faire de plus de 15 ans dans le domaine de la transgenèse chez le rat. Elle possède également une expertise en immunologie et transplantation.

La plateforme est accessible aux unités de recherche académiques et aux entreprises. Elle développe à façon des modèles de rats transgéniques, knock-in ou knock-out, pour l'étude de pathologies humaines, de gènes et de fonctions biologiques. Elle est aussi spécialisée dans l'immunophénotypage et l'analyse de la réponse immune de modèles de rats génétiquement modifiés. Ses activités de R&D lui ont permis d'être pionnière dans le développement et la validation de technologies innovantes pour l’édition du génome chez le rat.

Expertises et services

  • Production à façon et en routine de rats transgéniques par microinjection embryonnaire de fragments d’ADN ou de vecteurs lentiviraux,
  • Génération de rats KO et KI par microinjection embryonnaire de nucléases spécifiques de gènes (nucléases CRISPR-Cas9),
  • Immunophénotypage et analyse de la réponse immune de rats génétiquement modifiés,
  • Single cell sorting de cellules B antigènes spécifiques et production d’anticorps monoclonaux humains chez des rats humanisés,
  • Design et synthèse de sgRNA,
  • Design, génération et purification d’ADN donneur,
  • Génotypage (PCR, qPCR, southern blot, LAM-PCR),
  • Cryoconservation d’embryons transgéniques, KO et KI,
  • Mise à disposition de rats transgéniques, KO et KI déjà générés,
  • Conseil pour le choix de promoteurs, de constructions d’ADN et techniques de criblage,
  • Formation et perfectionnement aux techniques de transgénèse,
  • Développement de nouvelles procédures expérimentales, modes opératoires, technologies, et transfert de savoirs vers l’industrie via des MTA,
  • Enseignement, diffusion de la technologie de transgénèse et animation scientifique : organisation de colloques et congrès, formation d’étudiants et de personnels, rédaction de publications scientifiques, édition d’ouvrage...

Moyens et équipements

  • Equipements de microinjection : microinjecteur, approcheurs manuels, caméra, moniteur,
  • Electroporateur NEPA,
  • Portoirs ventilés (capacité de 60 cages rats),
  • PSM pour le transfert d’embryons,
  • Hotte de change,
  • Cytomètre FACS Verse,
  • Trieur de cellules FACS Aria,
  • Equipements de biologie moléculaire : thermocycleur, TaqMman, LabChip GX II et GX-Touch, système d'électrophorèse capillaire,
  • Equipements de culture cellulaire : PSM, centrifugeuses, incubateurs à CO2,
  • Congélateurs à -20°C, -80°C et -150°C.

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Comment soumettre un projet ?

Pour soumettre un projet à TRIP, vous pouvez contacter par mail Ignacio Anegon, responsable scientifique de la plateforme, en précisant brièvement vos objectifs. Vous serez recontacté pour discuter plus en détail de la stratégie, de la faisabilité, des délais et des coûts du projet.

Exemple d'utilisation

Création d’un modèle pour l’étude de l’hypertension artérielle pulmonaire

L’équipe de Frédéric Perros au Centre chirurgical Marie Lannelongue (Inserm U999) du Plessis-Robinson a contacté la plateforme TRIP pour étudier le rôle du gène KCNK3 codant pour un canal potassique. Chez l’Homme, les mutations sur ce gène sont toutes associées à des formes d’hypertension artérielle pulmonaire (HTAP). Aucun modèle n’était disponible pour étudier le rôle d’une dysfonction de KCNK3 dans cette pathologie.

Grâce à la technologie CRISPR-Cas9, la plateforme a généré une lignée de rats porteurs d’une délétion de 94 paires de bases dans l’exon 1 du gène KCNK3. Des analyses phénotypiques cardiaques et pulmonaires réalisées par les chercheurs ont montré que les animaux mutés développaient une pathologie similaire aux formes humaines d’HTAP. Ces résultats confirment qu’une perte de fonction de KCNK3 est un élément clé dans la pathogénèse de l’hypertension artérielle pulmonaire.

Pour en savoir plus : Lambert M. et al. (2019). Characterization of Kcnk3-mutated rat, a novel model of pulmonary hypertension. Circulation Research, 125(7):678-695.

Contact

TRIP
44000 Nantes
Région : Pays de la Loire+33 (0)2 40 08 74 10
ignacio.anegon@univ-nantes.fr
Site de la plateforme

Transgénèse rat et immunophénomique (TRIP)

 

THÉMATIQUES : Animalerie, exploration fonctionnelle

TUTELLES : CHU de Nantes, CNRS, Inserm, Nantes Université

INFRASTRUCTURES NATIONALES : CELPHEDIA

LABELLISATION IBiSA : 2008

RESPONSABLES SCIENTIFIQUES :
Ignacio Anegon

RESPONSABLES TECHNIQUES :
Séverine Remy

RESPONSABLES QUALITÉ :
Séverine Remy

MOTS CLÉS : Edition du génome, Rat, CRISPR, Nucléases spécifiques de gènes, Microinjection, Electroporation, Embryons de rats, Souris KO, Souris KI, Génotypage, Immunophénotypage, Rats humanisés, Modèles animaux

Fiche mise à jour en 2022


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