We-Met

La plateforme We-Met est spécialisée dans la biochimie des protéines. Elle propose différentes prestations au travers de 4 pôles distincts. Le pôle Simple Western permet l'analyse automatisée des protéines par électrophorèse capillaire à partir de différents types d'échantillons, tissus, cellules, organoïdes et sérum. Il fournit des prestations allant de la préparation des échantillons à la quantification des protéines. Le pôle Biomarqueurs réalise pour sa part des analyses par ELISA en microfluidique sur sérum ou surnageants cellulaires. Il offre également un service de développement à façon de tests ELISA via différentes technologies. Le pôle Seahorse permet quant à lui des analyses en temps réel du métabolisme cellulaire sans marquage, apportant une solution allant de la mise au point des conditions optimales à l'interprétation des résultats. Enfin, le pôle Outils moléculaires développe des techniques destinées à la production de protéines et à l'étude de l'interactome.

Expertises et services

• Analyse de protéines en capillaire par Simple Western sur tissus, cellules, organoïdes et sérum (centre de référence CSP pour le Simple Western),
• Analyse de biomarqueurs par ELISA (système Ella) sur sérum ou surnageants cellulaires,
• Analyse du métabolisme cellulaire par Seahorse en temps réel et sans marquage sur cellules et mitochondries isolées (plateforme accréditée Seahorse par Agilent),
• Développement d’outils moléculaires pour la production de protéines et l’étude de l’interactome, 
• Mise à disposition des équipements et technologies de la plateforme,
• Formation et accompagnement pour les projets de recherche et développement, la préparation des échantillons et l’exploitation des résultats,
• Participation à des études cliniques avec respect des bonnes pratiques cliniques (BPC).

Moyens et équipements

• 4 appareils de Simple Western (Bio-Techne),
• Automate Ella (Bio-Techne),
• Analyseur Seahorse XFe24 (Agilent) au format 24 puits,
• Analyseur Seahorse XF Pro au format 96 puits avec reproductibilité et précision améliorée, et contrôle qualité automatique des résultats de chaque puits,
• Système Incucyte SX5 (Sartorius).

Comment soumettre un projet ?

La plateforme We-Met est ouverte à la communauté scientifique, académique et privée. Les demandes de prestations peuvent être adressées par mail au responsable technique de la plateforme à l’adresse we-met.i2mc@inserm.fr, avec une courte description du projet, des objectifs, des techniques envisagées et du nombre de points d’analyse. Une réunion vous sera proposée dans les plus brefs délais afin de discuter de la faisabilité du projet et de son déroulement.

Exemple d'utilisation

Exploration du potentiel pathogène de la protéine HERV-W ENV

Les rétrovirus endogènes humains (HERV) sont des éléments génétiques résultant de l'infection ancestrale des cellules de la lignée germinale par des rétrovirus exogènes. Ils constituent jusqu'à 8% de notre génome. Certains HERV ont conservé leur potentiel d’expression sous la forme de protéines pouvant jouer un rôle physiologique ou au contraire, avoir des effets délétères pour l’organisme. C’est le cas de la protéine HERV-W ENV, impliquée dans plusieurs maladies, par exemple la sclérose en plaques. Activée par des virus exogènes comme celui de la Covid-19, elle induit des réponses pro-inflammatoires par l'intermédiaire de la protéine Toll-like et de la voie du récepteur Toll-like 4 (TLR4).

La société GeNeuro Innovation a développé un anticorps monoclonal recombinant dirigé contre HERV-W ENV. La plateforme We-Met a quant à elle mis au point un protocole d’extraction de la protéine et réalisé une analyse complète sur Simple Western pour la quantifier dans une grande variété de pathologies. La plateforme participe également à l’étude clinique de phase IIb menée par GeNeuro pour le traitement de patients atteints de Covid long. Elle s’investit par ailleurs sur le projet européen HERVCOV qui vise au développement d’un panel de biomarqueurs personnalisé pour le Covid long.

Pour en savoir plus : Charvet B. et al. (2023). SARS-CoV-2 awakens ancient retroviral genes and the expression of proinflammatory HERV-W envelope protein in Covid-19 patients. iScience, 19;26(5):106604.

Contact

We-Met
Inserm U1297, I2MC
CHU de Toulouse, Bâtiment L4
1 avenue Jean Poulhès
31432 Toulouse
Région : Occitanie+33 (0)6 82 46 74 78
we-met.i2mc@inserm.fr
Site de la plateforme

THÉMATIQUES : Biologie structurale, biophysique, biochimie, Protéomique, Autres

RESPONSABLES SCIENTIFIQUES :
Laurent Martinez

RESPONSABLES TECHNIQUES :
Alexandre Lucas

TUTELLES : Inserm, Université Toulouse III - Paul Sabatier

LABELLISATION IBiSA : 2023

MOTS CLÉS : Biomarqueurs, Simple Western, Analyse de protéines, Cytokines, Métabolisme, ELISA, Ella, Seahorse, Phénotypage métabolique, Biochimie des protéines

Fiche mise à jour en 2024

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