France Génomique

Infrastructure nationale de génomique et de bioinformatique associée regroupant les plateformes de séquençage de pointe pour l’étude du génome, de l’épigénome, du transcriptome et du métagénome.

Site de l'INBS

France Génomique

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France Génomique

France Génomique a pour mission la coordination et l’animation d’un réseau de plateformes de pointe en génomique, disposant des expertises et des instruments les plus performants, pour accompagner la communauté scientifique publique et privée dans la réalisation de ses projets de génomique, épigénomique, transcriptomique et métagénomique. Outre la production de données, France Génomique propose aussi leur traitement bioinformatique, en direct ou en collaboration avec les plateformes de l’Institut français de bioinformatique (IFB).

Dans un domaine technologique qui évolue très vite, France Génomique cherche à optimiser et maintenir au plus haut niveau le parc instrumental et l’expertise technologique et méthodologique associée. Il coordonne la veille, la réalisation des développements et la diffusion de l’expertise au sein des plateformes et de la communauté scientifique, par exemple au travers d’actions de formation, de workshops ou de colloques.

Depuis la révision de son périmètre en 2020-2021, France Génomique est constituée d'un noyau central de 13 plateformes qui constituent le cœur de l'infrastructure nationale. Autour de ce noyau, le réseau rassemble 8 plateformes de séquençage associées et 13 plateformes de bioinformatique associées. Celles-ci bénéficient de la veille technologique et sont invitées aux workshops et assemblées générales de France Génomique pour partager sur les développements technologiques réalisés. France Génomique bénéficie d'une infrastructure informatique centrale située au Centre de calcul recherche et technologie (CCRT) à Bruyères-le-Châtel et utilise les ressources de plusieurs mésocentres, notamment celles des plateformes de l’IFB.

Comment soumettre un projet ?

Pour soumettre un projet à France Génomique, il existe deux possibilités. Dans le cas où vous avez déjà identifié la plateforme avec laquelle vous souhaitez travailler, vous pouvez la contacter directement. Dans le cas inverse, vous pouvez soumettre votre projet sur le site web de l’infrastructure, en présélectionnant, si vous le souhaitez, un ou plusieurs sites de France Génomique. Tous les projets sont considérés et les demandes sont toujours redirigées vers les plateformes les plus à même d’y répondre. Notez que dans la plupart des cas, il est nécessaire d'envisager un financement par le porteur de projet.

Plateformes de l’INBS

11 plateformes identifiés

Biomics

PLATEFORME IBISA, France Génomique

Paris, Bioinformatique, bases de données, Génomique, transcriptomique

Structure dédiée à l’autonomisation et à la prise en charge complète de projets de séquençage de seconde (short-reads) et de troisième génération (long-reads).

Génome et transcriptome (GeT)

PLATEFORME IBISA, France Génomique, IBISBA-FR

Castanet-Tolosan, Génomique, transcriptomique

Une expertise et des équipements de pointe en génomique et transcriptomique : séquençage à haut et très haut débit, hybridation sur puces, qPCR et PCR digitale, single cell...

GenomEast

PLATEFORME IBISA, France Génomique

Illkirch, Bioinformatique, bases de données, Génomique, transcriptomique

Un savoir-faire en séquençage et microfluidique à haut débit avec une expertise en bioinformatique pour la réalisation d’analyses transcriptomiques, génomiques et épigénomiques.

GenomiqueENS

PLATEFORME IBISA, France Génomique

Paris, Bioinformatique, bases de données, Génomique, transcriptomique

Génomique fonctionnelle et séquençage à haut débit, du dessin expérimental à l'analyse des données, avec une expertise en analyse du transcriptome.

Gentyane

PLATEFORME IBISA, France Génomique

Clermont-Ferrand, Génomique, transcriptomique

Des outils technologiques de pointe et de nouvelles approches pour le génotypage, le séquençage à haut débit et la carte optique.

ICGex-NGS

PLATEFORME IBISA, France Génomique

Paris, Génomique, transcriptomique

Conseil et prestations de service en génomique, transcriptomique et épigénétique autour des thématiques du cancer et de la recherche biomédicale.

LIGAN-PM

PLATEFORME IBISA, France Génomique

Lille Cedex, Bioinformatique, bases de données, Génomique, transcriptomique

Des outils et des compétences en NGS pour les projets de séquençage, de génotypage, de transcriptomique, d’analyse bioinformatique et statistique.

Montpellier GenomiX (MGX)

PLATEFORME IBISA, France Génomique

Montpellier, Bioinformatique, bases de données, Génomique, transcriptomique

Séquençage nouvelle génération, transcriptomique en population et sur cellules uniques, génotypage, recherche de mutants/variants, qPCR à haut débit et analyses statistiques.

Plateforme de séquençage de l’I2BC (PSI2BC)

PLATEFORME IBISA, France Génomique

Gif-sur-Yvette, Bioinformatique, bases de données, Génomique, transcriptomique

Une expertise et des technologies de pointe en séquençage à haut débit pour la génomique, l’épigénomique, la transcriptomique et l’épitranscriptomique.

Transcriptomique et génomique Marseille Luminy (TGML)

PLATEFORME IBISA, France Génomique

Marseille, Bioinformatique, bases de données, Génomique, transcriptomique

Séquençage à haut débit et analyse de données dans le domaine de la génomique.

UCAGenomiX

PLATEFORME IBISA, France Génomique

Valbonne Sophia Antipolis, Bioinformatique, bases de données, Génomique, transcriptomique

Analyse quantitative de profils d’expression génique par séquençage courts (Illumina) et longs fragments (Nanopore), de l’organisme entier à la cellule unique.

Contact

France Génomique
CEA, Genoscope
2 rue Gaston Crémieux, CP5706
91057 Evry Cedex
Région : Île-de-France+33 (0)1 60 87 84 52
contact@france-genomique.org
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